漢代四合院建筑有了更新的發展，受到風水學說的影響，四合院從選址到布局，有了一整套陰陽五行的說法。唐代四合院上承兩漢，下啟宋元，其格局是前窄后方。
然而，古代盛行的四合院是廊院式院落，即院子中軸線為主體建筑，周圍為回廊鏈接，或左右有屋，而非四面建房。晚唐出現具有廊廡的四合院，逐漸取代了廊院，宋朝以后，廊院逐漸減少，到明清逐漸絕跡。
元明清時期四合院逐漸成熟。元世祖忽必烈“詔舊城居民之過京城老，以貲高（有錢人）及居職（在朝廷供職）者為先，乃定制以地八畝為一分”，分給前往大都的富商、官員建造住宅，由此開始了北京傳統四合院住宅大規模形成時期。1970年代初，北京后英房胡同出土的元代四合院遺址，可視為北京四合院的雛形。后經明、清完善，逐漸形成北京特有的四合院建筑風格。
