檸檬在氧氣濃度低于3％、二氧化碳濃度高于10％的條件下貯藏一段時間，會對風味產生不良的影響。10％以上的二氧化碳可增加檸檬的腐爛和減少酸 味。氧氣低于5％可引起檸檬變味。重視采前管理、適時采收、選擇適宜的采收方法、及時防腐處理、選果、分級、打蠟、包裝和貯藏管理等都可延長檸檬貯藏期。 在我國四川，檸檬的采收一般在10月下旬--11月下旬，可貯藏到次年5月。
一、采收標準
1．成熟標準。果汁含量達28％--30％(依級而定)
顏色：深綠色果子有很長的貯藏期，黃色果采摘后必須馬上上市。
2．質量標準。果實黃色的程度及均勻性，果實大小、形狀、光滑度、酸度，無腐爛、凍害、干涸果，無機械損傷，無果皮污點、紅斑、皺縮、雜色等。
二、保鮮方法
1．化學保鮮法。①用品。5％的高錳酸鉀水溶液，5％的漂白粉溶液，燃燒后的蜂窩煤殘渣或活性炭，塑料編織袋。②保鮮劑制備。用5％的高錳酸鉀溶液浸 泡蜂窩煤燃燒后的殘渣或活性炭數小時，然后將其撈出，瀝去溶液，置陰暗通風處晾至半干，制成小塊或小顆粒，即為保鮮劑。③塑料編織袋消毒。將塑料編織袋用 5％的漂白粉清洗消毒，放在陰涼處晾干即可。④裝袋。將檸檬與保鮮劑按4：1的重量比一起裝入塑料袋中，封好口存放于低溫陰暗處，溫度在0℃--12℃最 好。用此法貯藏檸檬，貯藏期可達200天。
2．涂膜保鮮法(水果保鮮涂膜劑)。這是一種適用于柑橘、檸檬等水果的 涂膜保鮮劑。①配方。小燭樹蠟4．0千克，油酸1．2千克，二甲苯0．05千克，乙二醇0．1千克，石炭酸鈉0．2千克，嗎啉0．9千克，水22．2千 克。②配制方法。將以上物質加熱至80℃混熔后，加入80℃熱水中攪拌均勻。③使用方法。使用時可將檸檬洗凈，干燥后，浸涂一層涂膜劑，然后在10℃-- 20℃環境中貯藏。保鮮期可從1周--7周延長到10周--20周。
3．全能保鮮液保鮮法。美國科研人員最 近發明出一種用于水果保鮮的全能保鮮液，并且獲得美國專利。據介紹，這種功能齊全的保鮮液是將3％的檸檬酸或75％--80％濃度的食用級正磷酸的pH值 調至3．5以下，加入30％--40％的蔗糖，0．3％以下的苯甲酸鈉或抗壞血酸，0．03％的磷酸氫鈣配制而成。使用該保鮮液不僅能防止水果褪色，抑制 細菌繁殖，并且能防止水果皺縮、破裂，保持果肉質地不變，提高糖度且風味如新。
三、病害防治
檸檬生理性病害有冷害、油斑，病理性病害主要是綠霉病、青霉病、黑斑病等。
防治措施：小心采收，減少傷口、擦傷、劃破等損傷；采前實行殺菌劑或生物拮抗劑處理；快速降溫至適宜溫度；運輸和貯藏過程中保持適宜的溫度和相對濕度，減少乙烯積累；操作環境要清潔等。
