肝臟對來自體內和體外的許多非營養性物質如各種藥物、毒物以及體內某些代謝產物，具有生物轉化作用。通過新陳代謝將它們徹底分解或以原形排出體外。這種作用也被稱作“解毒功能”,某些毒物經過生物轉化,可以轉變為無毒或毒性較小,易于排泄的物質;但也有一些物質恰巧相反，毒性增強(如假神經遞質形成)，溶解度降低(如某些磺胺類藥)。肝臟的生物轉化方式很多，一般水溶性物質，常以原形從尿和膽汁排出;脂溶性物質則易在體內積聚，并影響細胞代謝，必須通過肝臟一系列酶系統作用將其滅活，或轉化為水溶性物質，再予排出。肝臟是最主要的藥物代謝器官
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