企業財務報表是企業一定時期財務狀況和經營成果的綜合體現，因此具體到某個企業，通過對財務報表的分析，如果企業存在涉稅風險，是可以發現疑點的。
分析資產負債表，可以用最短的時間全面了解企業在一段時期內的經營狀況，同時，資產負債表也是企業規避稅務風險和發現財務工作問題的手段。分析時可以將一些依據報表計算出的常見比率以月、年為周期進行匯總比對，也可以與同行業同規模其他企業相關比率進行橫向比對，從而發現疑點。
⑴應收賬款周轉率：企業在開展經營活動的過程中，應收賬款的額度需要控制在合理的范圍內，實際分析的過程中，可以通過對比行業應收賬款的平均水平，分析企業與行業之間的差距，如果超過合理范圍，則該企業在經營的過程中可能存在逃避稅收隱瞞收入的情況，需要重點關注。應收賬款周轉率分析的過程中，對比企業以往的應收賬款周轉率，在企業日常經營活動不存在異常的前提下，若企業的應收賬款周轉率在短時間內出現大幅度增加或減少的情況，就需要考慮企業可能存在隱瞞收入的情況，需要對企業賬目的真實性進行有效核查。
⑵資產周轉率：企業在經營過程中，用于周轉的資產大致包括固定資產、流動資產、總資產三類，企業資產流動的速度越快，說明企業的資金使用效率越高，在這種情況下，企業無論是盈利水平還是生產水平，都應該相應提升，如果企業的資產負債表顯示企業的盈利額度低于行業平均盈利額度，則要重點關注是否存在違規調節利潤的行為。
⑶存貨周轉率：如果企業的存貨周轉率高于行業平均水平，說明企業的貨物流動速度較快，企業倉庫中存貨量低于行業平均水平，在這樣的情況下，如果企業的繳稅額度相比以往有所下降，可能存在虛報成本的違規行為，但這并不是絕對的，需要充分考慮企業的實際經營情況，在市場經濟大背景下，外部市場環境也時刻發生變化，企業在實際開展經營過程中，也非常容易出現貨物滯銷的問題，但可以繼續核查。
利潤表也被稱為損益表，主要是反映一段時間內企業的經營效益，從企業主營業務收入的角度來講，以利潤表與基礎，主要反映毛利變動率、利潤變動率、成本變動率這幾項指標，如果企業外部市場基本未發生較大變化，那么，企業利潤表中以上三項數據也應該基本保持一致，一旦其中的某項數據發生異常波動，則說明企業在核算的過程中可能存在稅務風險。
從企業其他業務收入變動的角度來講，很多企業在實際經營的過程中，為了增加企業收入，會在主營業務之外，采取某些銷售手段銷售全次品和附加產品。
現金流量表是企業財務報表的重要組成部分，主要體現企業在一段時間現金的流動和儲備情況。
對現金流量表的主表進行分析，需要重點觀察企業經營收入與企業稅務支出和員工支出之間的關系是否存在不合理的因素，如果兩者存在較大偏差，說明企業在實際經營過程中存在銷售產品未入賬的情況。
對現金流量表的輔助資料進行分析，需要綜合考慮企業繳納所得稅的額度，以此為基礎分析企業的繳稅情況，在實際分析過程中，可以將企業的管理支出與企業的固定資產折舊費用進行比對，企業的非營業費用支出與企業無形資產的損益進行比對。
三個財務報表的項目之間及同一財務報表內部之間存在一定的勾稽關系，通過分析這些模糊的勾稽關系，可以識別財務報表中是否存在疑點。
精確的勾稽關系可以表達為平衡等式。比如：資產負債表左方的資產總計項目等于資產負債表右方的負債和所有者權益總計項目。這樣的會計報表編制原理限制下的精確關系，是報表成立的基礎，但這些不需要分析。
模糊的勾稽關系，則是一種內在的相對平衡，比如：現金流量表中“取得投資收益收到的現金”項目和利潤表中“投資收益”項目與產負債表中的一些投資性資產項目之間存在一定的關系，將三個報表中關于投資活動的業務串聯起來，如果出現破壞平衡的因素，則需要考慮是否出現了疑點，而這些疑點是否涉及到相應的稅務風險，比如：購買商品、接受勞務支付的現金與營業成本和購買商品的過程中會有一部分是未付現的原因而形成的應付賬款也是一組模糊的勾稽關系，關注應付款項的反向變動以非現金資產抵債、以應收低應付等情況，是否按照政策規定做了視同銷售的相關涉稅處理。
