| 煙斗清理的步驟，是必不可少的：保證下次使用時，不至被積聚的殘余煙油影響煙草的口感；同時，抽完一斗后，自己親自清理，也是樂趣之一。
每次抽完一斗，都應該清理煙斗。具體步驟是：
先把煙斗擱在一旁，等其完全冷卻下來（千萬不要在煙斗還發燙，甚至只是微溫時，拆開煙嘴！）。可以不急于清除缽中的煙灰及煙草殘屑，因為干燥的煙灰可以吸收一下水汽。煙斗涼透后，把煙灰和吸剩的煙草殘渣（Dottle），用三合一工具中的小勺小心挖凈，動作要輕，不要傷及內壁和積炭。必要時，還可以動用手指。千萬不要把煙斗猛磕在硬物上，這樣會損壞飾面，甚至令斗柄開裂！可以用柔軟的手掌代勞。
每次把冷卻后的煙斗拆開，這樣能清理得更仔細、干凈；榫口的死角，也用蘸過煙斗清潔液的化妝棉片清潔。然后，用一條干凈的通條，蘸些清潔液，經煙嘴直達缽底小孔，并旋轉通條，令其充分吸收殘留的焦油。另外再用一到多條干燥的通條，重復以上步驟，以吸干水分。另外可以把干燥的通條留在煙道內過夜，進一步吸收濕汽。也可以把用過的通條，折成“U”形，清除附在缽壁上的煙灰（可以把那少許煙灰留在缽壁，因為煙灰的化學成份也是碳（C），長此以往，可能有利于炭餅的積存；而干燥花白的煙灰還可不停地吸收斗缽的水分，一舉兩得）。
要注意的是，清潔液千萬不要沾到煙斗飾面及煙嘴上：因其多少含有酒精，會把蠟質溶掉，使表面變得暗啞無光，影響美觀；高濃度酒精所到之處，甚至會溶掉著色，造成飾面顏色深淺不一。
清理過后，把煙斗放在空氣循環較佳的地方，讓其自然干燥（休息）。另外，一但把煙斗拆開后，濕潤的木質榫眼會發脹，所以不宜馬上硬要裝回。
隨著煙油不斷積聚在斗缽內壁，并且氧化，煙斗累計抽過五到十次后，可能會散發出令人不快的酸味道。這時，是時候進行徹底的大掃除了。
把煙斗小心拆開，如上敘述，用蘸過清潔液的通條清理煙道，并用化妝棉片小心擦洗榫口殘留的“膠物”（常抽調味煙草<Aromatics>，“膠物”可能會特別多）及煙斗內缽壁（動作要輕，不要把積炭都洗掉了）。如果變味較嚴重，用棉片仔細襯入內缽壁，小心淌些白蘭地，這時，浸潤了的棉片就會緊緊地附在斗壁，煙油就被酒精慢慢地萃取出來，稍待 10 到 30 分鐘，等水分完全揮發后，再把褐黃的棉片抽出。
也許您還聽說過鼎鼎大名的“‘酒精和鹽’煙斗除味復蘇法”。這種方法，非常有效，不過具體操作比較麻煩，而且也有一定的風險。據說，大概有 1％ 的機會使斗柄開裂，尤其是煙斗本身有難以察覺的絲裂時，或者過程中容許混合物進入斗柄部分，又或者處理的時間過長，如幾天，甚至一個星期時間…… 所以，用此法處理價值特別高，或者個人意義特別大的煙斗時，就請三思而后行了 | 
