荷花的種球由圓球狀至圓錐狀的球莖( 或稱根莖)，及著生于球莖基部的貯藏根( 或稱營養球) 所組成，一個球莖可著生1-6 個不等的貯藏根。球莖上有二排對生的芽，但春季種植后一球莖通常僅萌一個第一代芽；新芽萌芽后，葉片展開3-5片時，開始抽出花序，隨后花序發育，花梗抽長并開花。在露天栽培下，切花長度約40-60 公分，遮陰處理則可達70 公分以上。
荷花的葉片為長橢圓形，中肋紫紅色，在露天栽培下，平均葉片長度約為30公分寬度約5 公分，一般比花莖短。但在遮陰栽培下，葉片較為狹長，長寬可達45公分，有時甚或比花莖還長。在田間栽培時，上午10 時以后，因日照強度增加，溫度升高，葉片常會因失水而有反卷現象。
荷花的花序為穗狀花序，花梗上端有7-9 片半圓狀綠色苞片，接著為9-12片彩鮮明的闊卵形粉紅色苞片，這些粉紅色的苞片形狀似荷花的花冠，是主要觀賞的部位。目前栽培品種的粉紅色苞片尖端帶有綠色斑點，是其特色也是他的缺點。
荷花真正的小花著生在花序下半部苞片內，每片苞片著生4 朵小花。小花為唇狀花冠，具3 片外花瓣，及3 片內花瓣；其中一枚內花瓣為紫色唇瓣，而且唇瓣中央漏斗狀的部位為黃色。
荷花新芽在頂芽花芽分化、開花的同時，莖基部逐漸肥大，形成圓球狀至圓錐狀的新球莖。新球莖的基部直根狀的營養根的根尖，則在入秋后逐漸肥大形成球狀的貯藏根，而形成新的種球。
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