在內功上，一直存在九陰和九陽誰更牛逼的爭論。
從抗擊打和治療能力看，九陽無疑高于九陰，郭靖在修煉九陰真經十余年后，被歐陽鋒打傷一掌，仍需養傷七日。反觀張無忌，在屠獅大會著了周芷若的道，重傷嘔血，沒一晚上便痊愈，眾皆駭然。而且張無忌在重傷后，仍能靠九陽的反彈之力擊斃圓真教徒，自身毫發無損，這種抗擊打能力已近乎少林不敗金身。這是郭靖所不及的。
從威力看，九陰很可能高于九陽。為什么這么說？我們不要忘了內功的成長性。九陰源自《道藏》，與全真教玄門內功同出一門，屬于后期選手（前期也驚人），厚積薄發，練10年和練30年完全是兩個檔次。所以郭靖20歲時明顯弱于歐陽鋒，30歲時已平手，40歲時雖然沒有和歐陽鋒交手的記錄，但是無疑超越了老五絕。20歲的郭靖和40歲的郭靖，差距其實非常大。而張無忌在山谷里憋了五年，就能一口氣把九陽練穿，雖說天賦秉異、仙果不斷，但也說明了些許差異。后來張無忌又練了不少功夫，但是九陽神功始終沒有進一步發展。
從實際戰績看，周芷若練九陰才個把月，張無忌在孤島上給她療傷（實為用九陽強壓九陰）便累得滿頭大汗，最后感嘆說芷若的內功將來絕不亞于自己。這是金書里唯一九陽選手和九陰選手單純以內力對抗的情節，結合上一段的成長性差異，還是有所意義的。
當然，具體到郭靖和張無忌身上，兩者的內功應當還是郭靖略高。這里借用張三豐的評語：無忌孩兒的眼神渾和內斂，這份內功修為當世只在郭大俠和覺遠大師身上見過。（這也表明在神雕里，郭靖的內功超越了周伯通、黃藥師、一燈、楊過等，畢竟他是唯一修煉全套九陰真經的男性。）郭靖在神雕結尾都56歲左右了，畢竟比張無忌足足多了36年左右的功力。這是兩門神功威力相近時，比較選手水平所不容忽視的差距。
