發生痢疾的羊羔一般可以用抗生素類藥物進行治療，如土霉素、痢特靈、磺胺類等藥物。在有條件的地區可以分離病羊感染的細菌做藥物敏感實驗，選擇最敏感的藥物作治療或預防。對于發生過梭菌性痢疾的地區應該使用梭菌苗免疫母羊 以防止羔羊發生此病。
預防羔羊痢疾主要采取加強母羊的飼養管理，使其所產羊羔體質比較強壯，有一定的抵抗力。羔羊產出后要立即吃初乳，并保證在2—3天內吃足初乳，提高羔羊的免疫力和抵抗細菌感染的能力。現在一般應用“三聯菌苗”或“四聯疫苗”定期免疫母羊，可以預防羔羊痢疾、腸毒血癥、羊快疫和羊猝疽等病的發生。在做好免疫的基礎上，要加強對圈舍和產房的衛生清理和消毒，及時殺滅環境中的各種病原菌。
