關(guān)鍵詞:耐藥、外泌體、lncRNA、腎癌
直入主題,我們先解讀一下題目:Exosome-Transmitted lncARSR Promotes SunitinibResistance in Renal Cancer by Acting as aCompeting Endogenous RNA
又是A基因通過(guò)B基因/信號(hào)通路在C疾病中發(fā)揮D功能,今天就是要教你用這招4要素。
這是一篇經(jīng)典的研究外泌體在腫瘤中發(fā)揮功能的文章,且聽(tīng)Ds.S娓娓道來(lái)。
A基因、C疾病的由來(lái):
C疾病:本文章的研究腫瘤為前腎癌,這完全取決于臨床醫(yī)生的所在領(lǐng)域。
A基因的由來(lái):舒尼替尼是治療腎癌的有效藥物,但患者會(huì)產(chǎn)生耐藥性(非常經(jīng)典的臨床問(wèn)題出發(fā)點(diǎn))。解釋耐藥機(jī)制和尋找到新的治療策略在臨床中具有非常的研究?jī)r(jià)值(臨床的重要意義)。lncARSR如何獲得?在小鼠模型中經(jīng)過(guò)舒尼替尼處理通過(guò)尾靜脈獲取舒尼替尼耐藥的RCC細(xì)胞,然后進(jìn)行l(wèi)ncRNAs芯片,最終通過(guò)RNAi實(shí)驗(yàn)確定出與舒尼替尼耐藥相關(guān)的lncARSR(Fig1)。舒尼替尼治療的腎癌患者,獲取他們的血漿和組織檢測(cè)lncARSR的表達(dá)量并判斷其臨床價(jià)值(Fig2)。
Fig1
Fig2
lncARSR在耐藥株細(xì)胞的外泌體表達(dá)。lncARSR被包入外泌體經(jīng)過(guò)hnRNPA2B1介導(dǎo)(Fig2)。外泌體傳送的lncARSR參與了舒尼替尼的耐藥過(guò)程(Fig3)。
Fig2
Fig3
B分子機(jī)制----lncRNA的ceRNA機(jī)制
lncARSR位于外泌體,既lncARSR位于細(xì)胞胞漿內(nèi),位于胞漿內(nèi)的lncRNAs一般發(fā)揮ceRNA的調(diào)控機(jī)制。基于此,本文章則采用經(jīng)典的ceRNA研究思路。(Fig4和Fig5)
Fig4
Fig5
Fig6
好了,又一個(gè)漂亮的故事誕生了,lncARSR通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合miR-34和miR-449導(dǎo)致AXL/c-MET的增加進(jìn)而激活STAT3, AKT, and ERK 信號(hào)通路促進(jìn)腎癌細(xì)胞對(duì)舒尼替尼的耐藥;同時(shí),lncARSR可以被包被至外泌體傳遞至舒尼替尼敏感株,導(dǎo)致敏感株的耐藥(Fig6)。
現(xiàn)在大概了解如何用外泌體研究大概要怎么做了吧?那么如何搞定外泌體抽提和鑒定呢?我們也給大家準(zhǔn)備好啦。想看的戳這里。
文章解讀小結(jié):
1. 要發(fā)表高分的SCI文章,ABCD模式一招鮮吃遍天,發(fā)現(xiàn)A基因(轉(zhuǎn)錄組測(cè)序或表達(dá)譜芯片),闡述其在C疾病中的D功能:細(xì)胞學(xué)功能和動(dòng)物模型;以及B信號(hào)通路:分子機(jī)制(上游+下游)、功能恢復(fù)實(shí)驗(yàn)。
2. 對(duì)于待研基因,闡述其在某種疾病中的功能:臨床相關(guān)性、細(xì)胞學(xué)功能、分子機(jī)制(上游+下游)、信號(hào)通路、功能恢復(fù)實(shí)驗(yàn)、動(dòng)物模型、實(shí)驗(yàn)結(jié)論的臨床回顧,關(guān)鍵在于“新基因”—新疾病—新機(jī)制。
根據(jù)吉?jiǎng)P基因的經(jīng)驗(yàn),從樣本出發(fā)芯片,測(cè)序,質(zhì)譜方法高通量篩選新功能基因的概率大約在10%左右,想要篩選驗(yàn)證得到一個(gè)新功能基因的難度非常大。吉?jiǎng)P基因歷經(jīng)3年,斥資上億,已完成近6000個(gè)腫瘤相關(guān)基因的功能學(xué)篩選,從中找到明確的腫瘤功能標(biāo)志基因若干,等待您來(lái)尋寶~~~