改善腸道的益生菌是指對宿主有利無害的活菌群，主要有雙歧桿菌、乳酸桿菌和嗜熱鏈球菌、芽孢桿菌、酵母菌等制品。
益生菌有些是單一菌株制成，也的是多種菌的復合制劑。益生菌的特點是有菌株特異性和劑量依賴性。菌株不同來源分離的同一種、同一亞種，即該菌的不同菌株，如青春型雙歧桿菌、長雙歧桿菌。
改善腸道的益生菌主要的益生菌包括雙歧桿菌、乳酸桿菌和嗜熱鏈球菌、芽孢桿菌、酵母菌等制品，這些都可以改善腸道功能。
另外一些益生元如果糖、乳果糖、異麥芽糖和纖維素、果膠等，也可以促進益生菌制劑中的菌群生長，又進一步促進了宿主腸道中原籍菌的生長與增殖達到改善腸道菌群的作用。
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