第95條：太陽病，發熱，汗出者，此為榮弱衛強，故使汗出。欲救邪風者，宜桂枝湯。
第96條：傷寒五六日，中風，往來寒熱，胸脅苦滿，嘿嘿不欲飲食，心煩喜嘔。或胸中煩而不嘔，或渴，或腹中痛，或脅下痞硬，或心下悸、小便不利，或不渴、身有微熱，或咳者，小柴胡湯主之。
太陽中風，風為陽邪，陽性急而動，若侵犯人體，則必先與衛氣相合，摶結為一，兩陽兩搏，榮陰勢不能與其相敵，而有發熱汗出。內經云：陽加于陰則為汗。是以桂枝湯證的病機為榮弱衛強。
而第96條說的是太陽傷寒五六日或者太陽中風，均可導致少陽病的形成。少陽病衛陽不能司于外，榮陰不能守于內，則腠理大泄，邪氣乘虛而入，正氣與之相搏,而結于脅下。正氣與邪氣相爭，而有“往來寒熱，休做有時”。其理與瘧疾相似，而程度不及。
《素問·瘧論》云：陰陽上下交爭，虛實更作，陰陽相移也。陽并于陰，則陰實而陽虛，陽明虛，則寒栗鼓頷也；巨陽虛，則腰背頭項痛；三陽俱虛，則陰氣勝，陰氣勝則骨寒而痛；寒生于內，故中外皆寒；陽盛則外熱，陰虛則內熱，外內皆熱則喘而渴，故欲冷飲也。又云：夏傷于大暑，其汗大出，腠理開發，因遇夏氣凄滄之水寒，藏于腠理皮膚之中，秋傷于風，則病成矣。夫寒者陰氣也，風者陽氣也，先傷于寒而后傷于風，故先寒而后熱也；病以時作，名曰寒瘧。寒則傷陽，寒邪入里則為水飲，是以“嘿嘿不欲飲食”。
《內經》病機十九條云：諸病水液，澄徹清冷，皆屬于寒。由此可見，小柴胡湯的病機為榮衛具弱，而桂枝湯為衛強榮弱。榮行脈中，衛行脈外。心主血以行營，肺主氣以布衛，心肺居上焦，上焦者，受陽而出氣，以溫分肉，養骨節，通腠理，今榮衛具病，上焦不通也，是所謂邪高；上焦不通，則中焦不化，陽郁于內而不出，不通則痛，是以“臟腑相連，其痛必下”；熱郁于內，與水飲相搏，而“做嘔”。所以傷寒論第97條又云：血弱氣盡，腠理開，邪氣因入，與正氣相搏，結于脅下。正邪分爭，往來寒熱，休作有時，嘿嘿不欲飲食。藏府相連，其痛必下，邪高痛下，故使嘔也，小柴胡湯主之。服柴胡湯已，渴者，屬陽明，以法治之。
由上可知，小柴胡湯的病機為正氣不足，營衛具弱，以至于上焦不通，中焦不化。是以《傷寒論》第230條云：陽明病，脅下硬滿，不大便而嘔，舌上白胎者，可與小柴胡湯。上焦得通，津液得下，胃氣因和，身濈然汗出而解。
那么，從病機上分析，小柴胡湯當為扶正氣以益營衛，開通上焦，助化中焦，清透郁熱，行散水飲。
