漢宣帝黃龍元年（壬申，公元前49年）十二月，漢宣帝駕崩，太子劉奭繼承王位，是為漢元帝，年僅三歲的劉驁被立為皇太子。按說，母以子貴，其生母王政君應被立為皇后，但漢元帝卻猶豫不決。因為，漢元帝此時最寵愛的妃子是傅氏和馮氏，況且傅妃也生下一子，名劉康；馮妃生下一子，名劉興，漢元帝想把皇后的鳳冠給傅妃。然而，劉驁既立為太子，皇后的桂冠按傳統規制當屬于王妃。最后，漢元帝在無可奈何的情況下立王政君為皇后。心有不甘的他，居然創設了一個地位僅次于皇后的‘昭儀’（昭儀位視丞相，比諸侯王）名號，來封給心愛的傅、馮二妃，并立劉康為定陶王，劉興為信都王。王皇后徒有皇后尊號，卻被冷落一邊，好在她生性柔順，不是爭風吃醋的女人。漢元帝對皇后的家人，照例給予了恩典，王氏家庭封王者多至十人，為西漢末年外戚擅權埋下了禍根。后來，太子劉驁越來越讓漢元帝不滿意。有一次，漢元帝召太子劉驁，聞詔慌忙前來的劉驁因不敢橫穿皇帝專用馳道而繞了一個大彎。漢元帝見太子來遲，于是責怪他，當劉驁說明原因后，漢元帝還是覺得十分高興。但好景不長，劉驁對讀書漸漸厭煩，整日游手好閑，除了喝酒、游玩，不干一點正事，漢元帝多次訓斥都屢教不改。于是，漢元帝打算廢黜劉驁，另立傅妃之子劉康。
漢元帝竟寧元年（戊子，公元前33年），漢元帝病重，傳傅昭儀、劉康在側侍奉，皇后王政君與太子劉驁卻被拒之門外。有一天，元帝向其近臣透露想要廢黜太子，另立劉康為繼承人。王皇后、太子得知后，惶恐不知所措。這時，漢元帝的寵臣侍中史丹闖進寢宮，頓首涕泣的說：“皇太子名聞天下，臣民歸心，今臣聽陛下有廢立之意，若是這樣，請陛下先賜我死吧！”元帝見狀，長嘆一聲說：“沒有此事！皇后謹慎，先帝又疼愛太子，寡人豈敢違先帝之意？”就這樣，劉驁保全了皇太子的名分，王政君也保全了皇后的鳳冠。同年五月，在位16年的漢元帝崩于未央宮，終年43歲，劉驁繼承王位，是為漢成帝，王政君則被尊為皇太后，移居長樂宮。即位后的漢成帝任命舅舅王鳳為大司馬大將軍，領尚書事掌理朝政，自己則整日游山玩水、斗雞走狗。其間，王太后的同母弟弟王崇也被封為安成侯，其異母弟王譚被封為平阿侯、王商為成都侯、王立為紅陽侯、王根為曲陽侯、王逢時為高平侯，世稱‘五侯’。王政君的生母李親，早年與王禁離異后改嫁茍賓。茍賓死后，王政君讓母親回去與父親王禁復緣。后來，成帝對王鳳的專權日漸不滿，有罷免王鳳之意。恰好京師地方升官京兆尹王章上書成帝，建議成帝貶王鳳，推薦中山王的舅舅馮野王取代王鳳。結果他倆密謀之事讓王政君的堂侄王音得知。官為侍中的王音，因在成帝左右侍奉，聽到消息后，不露聲色的他偷偷跑去通報王鳳。于是，王鳳遂罷朝在家并上書辭官，漢成帝覺得這是罷免王鳳的大好時機。誰知，王太后出來作梗，哭哭啼啼地不吃不喝向成帝施加壓力，成帝只好把王章打入死牢，杖斃獄中，其妻流放邊陲。
漢成帝陽朔三年（己亥，公元前22年），王鳳病重，其侄王莽（王政君最小的弟弟王曼之子）一直在側侍候，數月未解衣帶，令王鳳十分感動。因此在彌留之際，王鳳請王太后和成帝授王莽一官半職。王鳳死后，由王根輔政。五年后，王根因得病，力不從心的他遂上書推舉侄子王莽出任大司馬一職。
漢成帝綏和二年（甲寅，公元前7年），在位26年的漢成帝駕崩，因為沒有子嗣，由其弟定陶王劉康之子劉欣繼承王位，是為漢哀帝。王政君又被尊為太皇太后。哀帝即位后，其祖母傅昭儀、母親丁姬兩家成為新權貴，與王氏外戚在權益分配上發生沖突。于是，王太皇太后命王莽辭職以緩和矛盾。就這樣，王莽在極不情愿的情況下，上書辭官。
漢哀帝元壽二年（庚申，公元前1年），在位6年的漢哀帝駕崩，因其也無子嗣繼承王位，王太皇太后遂在哀帝駕崩當天，迫使哀帝把軍政大權交給王莽。于是，王莽又重登大司馬的寶座。王莽與王太皇太后迎立中山王劉興，年僅9歲的兒子劉衎繼承王位，是為漢平帝。因平帝年幼不能執政，由王太皇太后臨朝稱制，行使皇帝權力。然而，王政君遇事毫無主張，全盤依賴侄子王莽。不幾年，覬覦帝位已久的王莽便將朝政大權控制在了手中。隨著歲月的流失，漢平帝逐漸長大。王莽覺察平帝對自己的專權十分不滿，便下手鴆殺了漢平帝，擁立漢宣帝劉詢的玄孫，年僅兩歲的劉嬰為‘孺子’，自己則做起‘攝皇帝’。此時，王太皇太后才如夢初醒，后悔莫及的她，萬萬沒想到自己一手栽培出來的侄兒竟然篡奪了她兒孫的天下！
王莽居攝二年（丁卯，公元7年），也就是王莽攝政第三年，王莽將小皇帝劉嬰廢黜，堂而皇之地坐上了皇帝的龍椅。之后，他去謁見王太皇太后時對她說：“我己秉承天命，代漢而立，建立新朝。”昔日掌握實權的王太皇太后如今也只有憤慨、怒罵的能力了。
王莽始初元年（戊辰，公元8年）正月初一，王莽在未央宮前殿隆重地舉行了新朝皇帝即位典禮。王莽登上龍座南面稱帝，接受百官朝賀，奉王太皇太后‘新室文母太皇太后’的璽綬，并說既然漢朝已滅，太皇太后不得再侍奉元帝，遂毀元帝廟，改為‘文母篹食堂’。因王政君還在世，不便稱廟，便稱為長壽宮。王莽置酒請太后到長壽宮，太后見元帝廟已被廢棄，哭著說：“這是漢家的宗廟，皆有神靈存在，是犯了什么罪讓你毀掉！假設鬼神無知，修廟有什么用？如果有知，我原本是人家的妃妾，怎能辱沒先帝之廟來做為我用食的地方？！”于是酒會不歡而散。她曾私下向左右侍從說：“此人侮慢神靈，怎能長久得到上天保祐！”
王莽代漢自立后，覺得只有接管漢氏玉璽，才算是真正的取代了劉室天下。因此，他稱帝不久，便迫不及待地遣堂弟王舜去長樂宮向太皇太后索要‘漢傳國璽’。王太皇太后大怒，指著王舜的鼻子罵道：“王舜，你家蒙受漢室皇恩，卻不思報答，反而乘漢室人孤勢薄，助王莽篡位。像你們這樣的人，豬狗不如。我乃漢室老寡婦，活不了幾天了。我死了，就讓這塊玉璽陪葬，他王莽休想得到！”王舜伏在地上，羞赧汗顏。很久，才抬頭對太皇太后說：“皇上意在必得，太后今天不給，明日還能不給嗎？”太皇太后擔心王莽得不到‘漢傳國璽’會狗急跳墻，遂拿出玉璽，扔在王舜面前，并大罵道：“我老將死，你們兄弟定受滅族的報應！”太后怒中擲玉璽于地時，玉璽被摔掉一角，后以金補之，從此玉璽留下瑕痕。
漢代在宮中侍奉的官員都著著黑貂，王莽更為黃貂。太皇太后因思念漢朝，拒絕按新朝禮行事，而且命令侍從仍著著黑貂，王莽見了也無可奈何。太皇太后在悲憤中度過了她一生中最后的時光.，出生于漢宣帝時的王政君一生共經歷了七朝，雖沒有什么政治野心，但終因她的軟弱無能，斷送了漢朝劉姓的江山。
王莽始建國五年（癸酉，公元13年）二月，王太皇太后去世，享年84歲，謚為‘孝元皇后’，與漢元帝合葬渭陵。她是中國歷史上最長壽的皇后之一，僅次于清朝順治帝的‘孝惠章皇后’。
考古發現：渭陵位于咸陽城北5公里處渭城區周陵鄉新莊村，始建于漢元帝永光四年（公元前40年）。陵園近方形，南北四百一十米，東西四百米，四周有夯土筑成的垣墻，垣墻正中各置闕門，與陵冢底邊正中相對。陵園四門距陵園正中的封土堆約為110米左右。陵冢位于陵園之中，呈覆斗形，冢底邊長約115米，冢頂邊長50米，高25米。今陵冢頂部已塌陷，面積約400平方米，深約2米。在渭陵北300米處，發現一建筑遺址，東西長約200米，南北寬約100米。遺址地面土層清晰，漢代殘磚碎瓦比比皆是。建筑墻基、平鋪方磚的居住面和路面遺跡猶存，并出土了一批玉雕和其他文物。考古工作者根據建筑布局和出土文物推測，此遺址可能是渭陵寢殿或者是原廟建筑。渭陵西北380米處，有一座高13.5米的墓冢，四周有墻垣，每墻均于中央辟門，門外有雙闕。從其位置和規格來看，應當是漢元帝皇后王政君的陵園。
