1、注冊難易程度不同。
個體戶沒有注冊資金要求，只要有個小店面的出租證明，帶上身份證即可辦理。
有限責任公司登記既需要規定的注冊資金，也需要銀行繳稅帳戶，還要有正規的辦公場所，較之個體戶要復雜的多。
有限責任公司最低注冊資金3萬元人民幣，一人有限公司最低注冊資金10萬元人民幣。有限責任公司注冊時還需要公司章程。
2、代理注冊的成本差別很大。
個體戶如果自己注冊麻煩，200-500元即可找人代辦，非常簡單。
公司如果找代理公司注冊的話，隨著不同的注冊資金，費用也會從2000-10000元不等。
3、債務責任不同。
個體工商戶對債務負無限責任，所以個體工商戶不具備法人資格。如果有債務，是無限責任，一旦產生負債，家庭財產也要用于償還。
而公司有法人，有限責任公司以出資額為限負有限責任。
公司注冊下來100萬，我投了30萬，那么我只要沒有其他違法行為，公司欠債1000萬，我也只需要承擔30萬。其他跟我沒關系。
4、起名方式不同。
個體工商戶或個人獨資企業在登記時不能冠“某某公司”名稱，只能叫“某某經營部、某某廠或某某設計室等。
公司則可以隨意起以“公司”為后綴的名字，假如是在香港注冊的話，還可以直接起“集團公司”，“國際集團公司”，可以包含"亞洲""香港"“世界”“投資”“實業”等字眼。這是很多騙子公司會到香港注冊根本原因，名字更有欺騙性。看起來很高大上，其實找代辦公司只需要5000-10000元即可注冊下來。
5、稅收額度不一樣。
個體戶，不需要用會計做賬，一般是稅務局定個額度，每月就交這么多。
有限責任公司的征稅，營業交易環節按發票征稅，經營所得環節一般采取定率或查帳兩種方式。
一般公司都需要有一個會計做賬，或者使用兼職的會計，每個月要300-500元。
6、稅收項目不一樣。
個體工商戶或個人獨資企業的經營所得只繳個人所得稅；
公司（含一人有限公司），屬于查帳征收，也就是根據企業經營中建立的會計帳本來收稅。其中發票是主要憑據。
公司需要繳納營業稅（針對服務業）、增值稅（針對商業公司）、企業所得稅（所有公司）、部分其它稅種（如建城稅、教育費附加等，非常少，可以忽略不計）。其中營業稅、增值稅按所開發票金額計算，稅率為4-6%左右，企業所得稅是對企業在一年里純利潤征稅，稅率為33%（小公司會有優惠，最低至18%），例如你的公司一年純利潤100萬，那企業所得稅是33萬元。
7、信用度不同。
個體戶信用度低，無法以個體戶營業執照的名義對外簽合同。
公司相對來說更可信。舉個最直觀的例子，淘寶店鋪和天貓店鋪，一定程度上就是個體與公司的區別，天貓看起來就更高大上一些。
8、享受優惠政策不同
個體戶不享受到優惠政策，每年稅局都要定稅，如一不小心每月收入被定超過3萬，每個月光交增值稅就要近千元。
限公司需每個月做帳和報稅，可以享受稅收優惠政策。很多地方的公司政策一季度只要開發票不超過9萬，都可以免稅。
9、所開發票不同。
個體工商戶不可以申請稅率為17%的增票，只能申請小規模納稅人（3%）。
而有限公司公司則可以申請到17%的一般納稅人增值稅發票。
10、破產保護情況不同。
個體戶做生意虧了本，你自己得對全部債務負責，個人目前沒有破產保護一說。
有限公司做生意虧了本，可向法院申請破產保護，如你注冊公司時的注冊資本金為50萬，而你欠別人200萬元，你只需還50萬即可，且受法律保護。
