“黃金家族”是指成吉思汗的直系子孫，皇族，是最純正的蒙古人，也是可汗的代稱，文獻記載，“天子成吉思汗之黃金家族”。所以，黃金家族也可以理解為蒙古的皇家貴族——孛兒只斤家族。
在 成吉思汗死后，只有他的兒子術赤、 窩闊臺、 察合臺、 拖雷四人的后代被稱為“黃金家族”，是皇族正統，才有資格繼承四個汗國的汗位。拖雷的兒子 蒙哥奪得蒙古大汗之位后，這個范圍又進一步縮小，黃金家族就是指拖雷的后代，一直往下順延，直到
孛兒只斤·巴圖孟克（達延汗），均來自托雷一脈。
當年，唯一一位不是黃金家族的大汗--綽羅斯·也先稱汗，為解決后顧之憂，把成吉思汗的后代子孫屠殺殆盡， “ 凡故元頭目苗裔無不見殺”，也先對元朝皇族的屠殺，引起蒙古各個部落的強烈不滿，再加上 “只有成吉思汗的子孫才有資格當汗”的傳統觀念，汗位還沒有坐熱就被部下殺掉了。也先死后綽羅斯的實力衰退，汗位又回到黃金家族的手里，他就是成吉思汗的第十五世孫，也先的外曾孫孛兒只斤·巴圖孟克，他的出現讓蒙古草原重現生機，為了實現對蒙古的統一，連續數年對瓦剌作戰，1506年終于將其擊潰，漠南蒙古統一，草原出現很長一段比較安定的生活環境，對蒙古的社會的經濟發展有很大促進作用，蒙古歷史上被稱為“中興之主”，巴圖孟克被譽為“達延汗”，明史稱為“小王子”。
達延汗主政后將察哈爾部作為汗王所在之地。從此以后，重新確立了黃金家族的汗系傳承僅屬于察哈爾部的子孫承襲。察哈爾部也被稱作了蒙古中央萬戶，成為各部的宗主。就這樣，黃金家族在察哈爾部一代一代的傳承，終于傳到林丹汗這一代。
林丹汗主政的時代，女真部落的首領努爾哈赤起兵東北。蒙古各部落也陷入分裂，左右翼蒙古分為了科爾沁部、內喀爾喀五部、察哈爾部、永謝布部、土默特部、鄂爾多斯部。
漠南蒙古雖名義上尊林丹汗為共主，但各自擁兵自固，林丹汗面臨來自明朝和金的雙重壓力，很難將各部統一。1632年，清太宗皇太極率領后金與蒙古聯軍對林丹汗發動了西征，林丹汗大敗西逃，死在甘肅，1635年，皇太極派多爾袞、等率軍遠征察哈爾余部。其子額哲走投無路被迫呈現玉璽，投降后金，這件事情意義重大，代表著黃金家族一脈在蒙古草原的宗主地位轉向滿族人建立的后金，標志黃金家族在草原上的宗主地位徹底不復存在。
1636年，蒙古各個部族首領聚集在盛京，承認清太宗皇太極為蒙古可汗“黃金家族”的繼承者，尊皇太極為蒙古大汗“博格達·徹辰汗”，意為“寬溫仁圣”之意。自此，蒙古大汗的法統由黃金家族轉入清朝皇帝手中，清朝皇帝成為草原蒙古各部的共主。
投降清朝的林丹汗的兒子額哲隨后被封為察哈爾親王，皇太極將女兒固倫溫莊長公主嫁給了他。但是清朝對察哈爾部仍然處處防范，額哲僅僅因為與公主吵架就被治罪。
額哲死后，弟弟阿布奈襲王位，但是阿布奈對先人所受的侮辱耿耿于懷，被清廷治罪囚禁，王位由其子布爾尼繼承。布爾尼繼承王位后同樣不服清朝統治，趁吳三桂之亂，認為時機已到，起兵反清，“布爾尼之變”不到兩個月就輕松鎮壓，以失敗告終，不僅布爾尼被殺死，其父阿布奈也被處死。自此，蒙古王公全部順從了清朝。
從此，黃金家族到了布爾尼這一代絕嗣。
