雖然CBE和ABE能實現C到T和A到G的轉換，但是其他不同堿基之間的轉換仍然受限，于是研究者繼續開發出能適應所有堿基轉換的技術——先導編輯器（Prime Editor，PE）。PE除了能實現堿基的替換，還能有效實現多堿基的精準插入和刪除[7]。PE也是以CRISPR/Cas9系統為基礎，由改造的sgRNA（pegRNA）和融合蛋白組成。pegRNA是在原先sgRNA的基礎上添加能互補斷裂的靶DNA鏈3’末端的序列（PSB）和帶有突變位點或插入缺失的目的序列（RT模板）。而融合蛋白是nCas9（H840A）與逆轉錄酶融合而成。PE的工作原理是pegRNA引導融合蛋白到達靶序列區，然后nCas9斷裂被編輯的DNA，接著PSB結合上斷裂的靶DNA，在逆轉錄酶和RT模板下逆轉錄出含有突變位點的目的序列。反應結束后會形成帶有目標突變的3’flap結構的DNA鏈和無任何突變的5’flap結構的DNA鏈。細胞內5’flap結構易被結構特異性內切酶識別并切除，之后經DNA連接和修復便實現了精準的基因編輯（圖4）。
圖. PE的工作原理[8]
