東吳從建安元年開始，至257年，62年來五次出兵平閩，閩中方歸孫權。為了加強對閩中的統治，吳國于260年撤銷南部都尉，在福建設立建安郡(在今建甌)，下轄5個縣。撤都尉改設郡，實現了以文治代替武人統治的局面。
此時，江南漢族居民分別由海路和陸路入漫漫，散居全閩各地，尤其是閩東和閩北，他們帶來的語言奠定閩東和閩北方言的基礎。
早在三國以前，閩南已有一定數量的居民，戶數估計有一萬左右。由于冶縣建立之后的300年來，閩南泉州地區是朝廷鞭長莫及之處，偶有戰事也都集中在閩北、閩東，直至東吳入閩，戰火也只波及閩江周圍。因此這些入閩漢族移民逐漸占據了整個閩南地區，并且同化這一帶的閩越遺民。
由于經濟的發展和人口的增加，西晉于282年從建安郡分出部分地域，另設晉安郡，下轄8個縣。于是，福建有兩郡十六縣：閩北的建安郡所轄建安、吳興、東平、建陽、邵武、將樂、延平、綏城；沿海和閩西的晉安郡所轄侯官、原豐、溫麻、晉安、同安、新羅、宛平、羅江。
西晉末期，中原地區更加動亂，南遷入閩的北方人更多。308年，中原動蕩，衣冠始入閩者八族：林、陳、黃、鄭、胡、何、邱、詹。這就是歷史上所說的“衣冠南渡、八姓入仙”。在此之前，北方漢族人就有進入福建的，但為數較少；永嘉年間及其以后，北方漢人入閩較多，形成了一次高潮。
漢族人與閩越人朝夕相處，免不了會受閩越語的影響，語言多少吸收了閩越語的一些成分。但是總的說來，泉州地區漢人已是主體，閩越遺民不僅少而且分散，兼之文化較低，因此漢人終以壓倒多數的板塊遷移方式使漢語占有主導地位，最終取代閩越語。比如莆仙方言，就是外來的中原語系和當地的土著語系(閩越語)混合在一起，經過長期的融合演化形成的。
梁天監間(502—519年)，析晉安郡置南安郡，郡治設今南安豐州鎮。
梁太清元年(547年)，侯景之亂，三吳淪為戰場，長江中下的廣陵(揚州)、江州(九江)、建康(南京)、江陵等各城市都成為荒涼之地。這個時期，大批難民離開吳會入閩。三吳難民足跡遍及福建和廣東的潮州。這批移民是避難而來，且又分散各地，他們帶來的語言(吳語)雖然客不壓主，無法取代當地語言，但卻給泉州方言等閩語次方言注入了新鮮血液。這個時期的語言交融促使閩語內部各次方言進一步趨于一致，留下了一批吳語詞匯。
陳永定元年(557年)，在晉安郡置閩州(治所在今福州)，為福建歷史上的第一個省級建制，轄晉安、建安、南安三郡。不久，改閩州為豐州，州署設晉安郡(治所在今福州)。
589年，隋王朝改州、郡、縣三級制為州、縣兩級制，大幅度地裁減郡、縣。降建安、南安二郡為縣，改豐州為泉州(治所在今福州)，福建歷史上始見“泉州”地名。606年，復改泉州為閩州。607年，廢除州治，改閩州為建安郡。至此，閩中全境之晉安、建安、南安三郡合并為建安郡；全閩九縣裁并為閩縣、建安、南安、龍溪四縣。
唐太宗李世民繼位后，對州、縣大加并省，并依山河形勢、地理區域分全國為十道。福建屬嶺南道，下轄豐州(治所在今泉州)、泉州(治所在今福州)、建州(治所在今建甌)。
622年，唐于南安故郡地置豐州，州治在今南安市豐州鎮；豐州下領南安、莆田、龍溪三縣。627年，豐州撤銷，南安、莆田、龍溪三縣并入泉州(治所在今福州)。
684年，析泉州(治所在今福州)之南安、莆田、龍溪置武榮州，州治在今南安豐州。不久，武榮州廢，三縣仍屬泉州。699年，復以南安、莆田、龍溪三縣置武榮州，治所仍設今南安豐州鎮。同時析莆田縣西界置清源縣，隸屬武榮州。700年州復廢，屬縣仍隸泉州(治所在今福州)。 700年，又于今泉州市區置武榮州，轄南安、莆田、龍溪、清源4縣。
711年，武榮州改稱泉州，改泉州為閩州都督府(省級建制機構)，泉州隸屬閩州都督府。此后凡稱“泉州”，即指今之泉州。開元間(713--741年)，泉州轄南安、莆田、龍溪、清源、晉江五縣。
742年，唐廷下詔改州為郡，泉州易名清源郡，仍屬嶺南道，760年清源郡改屬江南東道。清源郡領南安、莆田、仙游(原清源縣)、晉江四縣，后來清源郡復為泉州。
733年唐從福州、建州各取一字，名為福建經略使(軍區長官職)，始稱“福建”。唐代相繼設置福、建、泉、漳、汀五州，至771年正式成立福建觀察使，成為地方最高長官，形成頗具規模的行省雛型。
669年，陳政、陳元光父子帶領軍人及其隨軍家屬征蠻并在福建駐扎下來。據《潁川開漳族譜》，陳政先是統率府兵5600名入閩，后又以兵少請援。朝廷命陳政的兩個兄長陳敏、陳敷領兵南下。估計入閩的這兩支軍隊有萬人左右。他們最終在漳州立足，被稱為開漳始祖。
“安史之亂”時中原地區戰亂頻繁，而地處東南一隅的福建，卻又成為北方人民避亂南遷的樂土。
唐朝末年，淮南道光州刺史王緒由于無法應付大軍閥秦宗權的勒索，悉舉光、壽兵五千人，驅吏民渡江。于885年進入福建，有眾數萬。后來，由于王緒濫殺部眾，光州固始人王潮被推舉為新的統帥，由南康經贛州、再轉潮陽、到達泉州、立足福州，終于平定福建。王潮死，其弟審知繼之，審知死，其子延翰建閩國，更四主而亡。從王氏入閩至閩國滅亡，王氏經營福建達60年之久。在其統治期間，光州、壽州移民散布于福建各地，發展繁衍，對福建人口影響很大。唐代福建地廣人稀，元和年間僅有74.4677萬戶。唐末黃巢入閩，“殺人如蟻”，使福建人口又進一步減少。從當時福建人口比重來看，唐末福建原有人口不過數萬戶而已，而入閩的光、壽移民又達數萬人，若以一戶五口為計，僅僅這一批北方移民，可能就占了福建總人口的1/5！
唐朝五代時期入閩漢人帶來的語言已經是中古時期的北方官話方言(即白話文系統)。是時泉州方言民經根深蒂固，北方方言已無法改變泉州方言系統，而只能“入鄉隨俗”，最終融入泉州方言。
王審知次子王延鈞殺兄篡位稱帝，升福州為長樂府，立為東郡，領福、泉、建、汀、漳、鏞(將樂)、鐔(延平)七州。945年，王氏“大閩國”被南唐滅亡，南唐和吳越分割建州與福州。莆田以南的泉、漳二州，為南唐泉州散員指揮使留從效割據，南唐封留從效為晉江王，并改泉州為清源軍。留氏卒后，繼由清源軍統軍使陳洪進割據。陳洪進割據漳州、泉州達19年之久，擁有近2萬人的武裝部隊。964年，清源軍改名平海軍，名義上歸兩浙西南路。978年陳洪進上《納地表》，將其所轄漳、泉二州14縣獻給宋廷。
宋代的地方政權建置基本上承襲唐朝五代之州、縣制。宋時的軍、州、府實為同級行政機構，州、縣以上的路，相當唐朝的道。北宋時，福建稱福建路，行政區劃為福、建、泉、漳、汀、南劍六州和邵武、興化二軍。南宋升建州為建寧府，福建因此包括一府五州二軍，共計八個同級行政機構，故號稱為“八閩”，共轄42縣。
979年，劃莆田縣百丈鎮和仙游縣游洋鎮及福州之永福(今永泰縣)、福清一部分，另置興化縣，縣治設在古邑(今仙游游洋)。同年，在古邑建太平軍，又改為興化軍，直屬兩浙西南路，轄莆田、仙游和興化三縣。983年，閩地從兩浙西南路分出，獨設福建路，興化軍隸屬福建路。
1276年，元軍占領臨安，益王趙 在福州即位，改號景炎，提升福州為福安府，定為行都。
1277年，改興化軍為興安州。同年底興安州為元軍所陷，興安州改為興化路。
北宋仁宗時期閩學開始萌芽
