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生命的起源|3 從有機分子到細胞生命【復旦趙斌教授公開課】


從有機分子到細胞生命。我們知道,生命的兩大基石是蛋白質和核酸。雖然我們前面兩節課,并沒有解決地球上蛋白質和核酸的起源問題。但我們現在不得不假設一下,說好了啊,只是假設。假設在原始地球條件下,這兩大物質已經形成了。但很明顯,這兩種生物大分子單獨存在的時候并不會表現任何生命現象,而我們平時看到的大分子的生命現象,是因為它們形成了多分子體系。那么,現在很直接的問題就是:生物大分子是如何組裝成多分子體系呢?它們需要在什么條件下才能組裝呢?所以,這是生物大分子合成后,緊接著要解答的問題。目前有兩個經典的實驗模型也許可以給我們提供一些思路。

第一個呢,是前蘇聯生物化學家奧巴林所提出的團聚體模型。他認為呀,原始海洋中的生物大分子要想繼續演化成生命,必須組成一個體系,并形成一個分界或者一個膜與周圍環境分開,這才有可能維持一個相對穩定的環境條件進一步發生演變。他就思考這個問題,想到了將蛋白質溶液與核酸溶液混合起來,構成了一種多分子體系。然后他就在顯微鏡下觀察,果然就看到了團聚體小滴,與水之間有明顯的界限,這張圖就是他觀察到的團聚體小滴的照片。接著,他又混合了更多的溶液來進行觀察,發現蛋白質與糖類、蛋白質與蛋白質、蛋白質與核酸,都可能形成團聚體。所以,奧巴林就認為,這些團聚體能表現某些生命現象,當然就可以作為生物模型來進行研究啦。但是,奧巴林所制造的這種團聚體,有一個很明顯的悖論,他用的原料是白明膠和阿拉伯膠,大家可能知道,這是現代生物體所產生的物質啊,有了生命之后,產生這樣的現象并奇怪呀。也就是說,最終呀,這個實驗觀察其實是缺乏說服力的。

第二個,就是美國科學家福克斯提出的類蛋白微球體模型。1959,福克斯以20種天然氨基酸為原料,模擬原始地球的干熱條件進行實驗。他之所以用20種天然氨基酸為原料,就是為了讓這種物質的生化機能與蛋白質接近,但是呢又不能是生物合成的蛋白質,所以,我們這里暫且稱這個為類蛋白吧。為了模擬原始地球的干熱條件,他就將各種氨基酸按一定比例混合,在干燥無氧條件下加熱到160℃~170℃,最后他得到了分子量很高的類蛋白微球聚合物,然后再這些物質放到很稀的鹽水中加熱,使其溶解,冷卻后溶液變成了白色渾濁狀,這就是就他在顯微鏡下觀察類蛋白微球體時拍攝的照片。

然后,福克斯就對此又做了很多實驗。他發現,當類蛋白微球體加壓的時候呀,會發生類似細胞分裂的現象。當改變類蛋白微球體懸液的酸堿度的時候,可以表現出雙層膜的特征。微球體懸液放置一段時間后,還可以看到出芽的現象。把芽分離出來,置于飽和的類蛋白溶液中,并從37℃冷卻到25℃,芽還可以生長,變成第二代微球,第二代微球也會和第一代微球那樣具有能分裂,出芽,長大等類似生物的現象。所以,通過上面所介紹的這兩個模型呀,說明了生物大分子是可以自動聚集起來的,并形成獨立的多分子體系。

剛才說到了膜,那么膜起源這個過程,首先是脂肪酸膜的出現,這樣,構成生命的化學物質就可以被捕捉到膜內,并孕育出更復雜的生命活動。但問題是,膜系統這樣復雜的結構,如何才能獲取自我復制和繁殖的能力,從而允許演化的發生呢?德國馬普研究所一幫科學家,就研究了這種化學活性液滴,也就是”化學物質在周圍液體和液滴內反復進出”的物理行為,發現這些液滴生長到細胞大小后就會自動發生分裂。咦,這種行為似乎與我們的常識不一致吧。大家在觀察水中油滴融合的時候,也許油滴只會變得越來越大,但并不會發生分裂。他們的這個研究結果,發表在2016 年 12 月的Nature Physics上,有興趣的可以看一看。這篇論文用化學活性液滴的生長、分裂行為來解釋細胞繁殖,大家看,是不是為我們描繪了又一個生命起源的可能圖景。

現在的大多教科書中都說:所謂細胞,就是出現膜結構,可區分出外部和內部。所以膜起源就非常重要。我們這里看一個膜起源假說,這個學說認為:膜結構和分隔化的形成是生命功能實現的必要條件,這樣的過程發生在3538億年前。這個假說還認為,原始的第一個細胞必須具備以下幾個基本性質:(1)有類似質膜的生物膜;(2)有能完成自我復制和自發整合的生命大分子物質體系;(3)具有內在的物質代謝、能量代謝和信息交流的基本性能。

這一張圖是我們熟悉的中心法則,我們知道如今的生命形式建立了從DNA到RNA,再到蛋白質的秩序,生命的主宰物質就是核酸和蛋白質。同樣,生物大分子起源的研究是解開生命起源奧秘的鑰匙,那么核酸與蛋白質究竟是哪個先發生的呢?排列組合一下,那只有三種情況:核酸先、蛋白質先、二者同時。但核酸先發生的可能性要大一些,因為核酸的構成成分相對來說比較簡單,聚合較容易一些。后來,RNA催化活性的發現,就解決了先有多聚核苷酸,還是先有多肽鏈的兩難困境,表明最初的生化系統是集中在RNA上,這就是著名的RNA世界假說。

該假說認為,在生命起源的某個時期,生命體僅僅由一種高分子化合物RNA組成,沒有蛋白質和蛋白質酶。而遺傳信息的傳遞是RNA的復制,其復制機理與當今DNA復制機理相似,而作為生物催化劑的蛋白質,因為需要基因編碼,所以那個時候還不存在。那么這個時候的催化反應只好由具備催化活性的RNA分子,也就是核酶來代勞了。此時,RNA是唯一的遺傳物質,是生命的源頭。

說到從原始生命體到真正細胞形態生命的這道鴻溝,我們不得不提及一下元古宙時期的藍細菌繁盛時代。以前的教科書認為藍細菌繁盛時代是從25億年到7億年前,但美國加州大學1989年的一項工作,將這個年限提前到了35億年前。我們知道,藍細菌是一種很奇特的生物,它能像植物一樣進行光合作用,但卻是原核生物,因此在進化生物學上有著非常重要的意義。尤其值得關注的是,這漫長的藍細菌繁盛,造成了地球環境的重大變化:首先,藍菌光合作用釋放氧氣改變了地球大氣成分,同時由于藍細菌活動引起的碳酸鹽沉積,大氣中的CO2含量逐步下降,為真核生物及多細胞生物起源創造了條件;其次,海洋物理化學性質發生改變,像這個鈣、鎂離子的濃度就開始下降,這當然就引起了pH值的相應改變;另外,地球表面平均溫度下降,這部分是因為大氣CO2濃度下降所導致的,我們能理解。而同時,我們知道,藍細菌繁盛時代所造成的環境改變,又是藍細菌自身衰落的主要原因。其實在生物進化中,許多物種的出現與衰落都有類似的情況。

我們再來看一些化石證據。15億年前的細胞化石,其個體的直徑只有10微米,而14億年前的細胞化石,其個體直徑達到了60微米。這個證據就說明,在地球上是先有原核細胞,再有真核細胞的。但是,真核細胞是不是真的來自原核細胞,或者說怎樣來自原核細胞,這些問題到現在為止還沒有一個滿意的答案。

那么,有關真核細胞的產生,現在有兩種爭論不休的說法,一種是分化假說,或稱為膜進化假說,另一種是共生起源假說。分化假說認為,真核細胞器是由原生質外膜向內伸和核質再分配而同時形成的,原核生物到真核生物是漸進的、直接的進化過程。但這里有一個問題是,既然各種細胞器是同時形成的,那為何不同的細胞器生化特性又如此不同呢?而共生起源假說則認為,一種較大的細胞把另一種較小的細胞“吞吃”到細胞里面,但并不把小細胞消化掉,而是與其建立起一種互惠的共生關系,即大細胞利用小細胞的某種功能,從中得益,小細胞則利用大細胞提供的環境與食物,得以更好的生存。正如我們這張圖所展示的,線粒體可能來源于紫細菌,葉綠體可能來源于藍細菌。而且,現在越來越多的分子生物學證據,還傾向于支持該學說。但這個學說也有一個問題,無法解釋細胞核的起源;而且,根據內共生學說,在代謝上占明顯優勢的共生體要將大量遺傳信息轉移到宿主細胞上,這顯然很讓人費解。

無論如何,我們知道真核生物在進化有非常重要的意義。首先,真核細胞的形成,為生物的性分化和有性生殖打下了基礎,也是推進生物進化的主要動力。在生物進化的30億年中,無性生物時代占了近三分之二的時間,生命長期處于單細胞階段,進化極為緩慢。有性生殖出現后,個體不再是一成不變地拷貝親本的基因。在有性生殖下,每個個體都有兩套基因,通過基因重組產生新的遺傳變異成為可能,提高了物種的變異性,增大了變異量,進化速度也就加快了。

其次,真核細胞的出現,推動了生物向多細胞化方向的發展。盡管從一些原核生物開始就有了多細胞化傾向,但原核細胞的遺傳系統根本就不足以實現細胞間復雜的遺傳調控,所以不可能進化到組織、器官的結構水平,只是停留在細胞集群的等級上。只有真核細胞才有細胞分化的可能,發展出分化組織,產生能行使特殊功能的器官,使生物向更高級方向發展。

有關多細胞生物進化的問題,我們下一節課再討論,本節課到此結束。

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