中醫(yī)屬于古代科學，而古代科學基本上都包容在哲學當中。很多人不了解哲學，以為哲學是空洞的想象，其實不然。哲學之所以有價值，就是因為自然內(nèi)在的統(tǒng)一性，這種統(tǒng)一性告訴我們，人和萬物一樣，不僅由同一種物質(zhì)組成，也由同一個原理支配，所以，人存在與發(fā)展的原理就是萬物存在與發(fā)展的原理 ，認識了自己，也就認識了自然，哲學就是通過認識自己來認識自然最普遍規(guī)律的一門學問。
顯然，哲學方法本質(zhì)上就是系統(tǒng)方法，它根據(jù)萬物在運動原理上的統(tǒng)一性，通過系統(tǒng)間的類比（取象類比）來認識萬物。有了這種方法論，我們就可以從宏觀系統(tǒng)來認識微觀系統(tǒng)，從可觀察的系統(tǒng)現(xiàn)象來認識不可觀察系統(tǒng)現(xiàn)象，進而對自然的本質(zhì)有更深刻的認識。
西醫(yī)來源于西方科學，來源于精密儀器的觀察，表面上它很科學，但在事實上，它觀察的只是表象。理由很簡單，自然界當中有很多東西是精密儀器觀察不到的，比如，人與自然的關系，整體與局部的關系，這些關系只能通過系統(tǒng)間的類比來認識，如果象西醫(yī)那樣基于觀察不到就不存在的理由否定了這些關系，那么中醫(yī)和西醫(yī)的矛盾就來了。
中西醫(yī)最大的區(qū)別在哪里？其實就在于對人與自然關系以及整體與局部關系的認識。西醫(yī)認識不到人與自然的關系，疾病的外因就找不到了，認識不到整體與局部的關系，疾病的內(nèi)因就找不到了，最終西醫(yī)把疾病的原因單調(diào)地歸于局部的細胞病變。但明眼的人一看就知道，細胞病變只是疾病的結(jié)果，而不是疾病的原因，把結(jié)果當成是病因，就會造成西醫(yī)在方法論上的錯誤。
看看中醫(yī)的疾病觀吧！認識到了人與自然的關系，就得出了人是自然無限小的一部分，順應自然則生，違背自然則死，疾病就是大自然對不順應它的人的一種懲罰；認識到了整體與局部的關系，就得出了細胞只是整體無限小的一部分，它們之所以病變，并不是細胞的原因，而是不平衡引起的整體管理失控造成的。
對病因的認識不同，治療疾病的方法論也完全不一樣。對西醫(yī)來說，既然把疾病的原因歸于局部的細胞，那么用外力殺死病變細胞就是西醫(yī)的全部。如手術切除、射線燒死、藥物毒死。而中醫(yī)呢？把疾病的原因歸于整體的管理失控，因此，治病的力量不是外力，而是整體的力量，因為只要恢復了整體的管理，病變細胞就會在整體力量的控制下改邪歸正。
一旦明白了中西醫(yī)的根本區(qū)別，就知道系統(tǒng)科學對中醫(yī)的重要性了，中醫(yī)本身就是建立在系統(tǒng)科學之上。顯然，人與自然的關系，整體與局部的關系都是系統(tǒng)科學所研究的對象，而對西醫(yī)來說，它根本無從下手，因為精密儀器觀察不到這些關系。如果基于觀察不到就不承認它們的存在，那么醫(yī)學的基礎就出現(xiàn)問題了。
系統(tǒng)科學能夠幫助中醫(yī)解決什么樣的問題呢？讓我們從系統(tǒng)科學的角度來分析一下：
第一，系統(tǒng)科學可以幫助我們認識經(jīng)絡的本質(zhì)。系統(tǒng)科學告訴我們，不管是生物還是非生物系統(tǒng)，它們都由同樣的物質(zhì)組成，也由同樣的原理支配，它們唯一的區(qū)別就在于系統(tǒng)內(nèi)部普遍聯(lián)系方式的不同，生物是靠水普遍聯(lián)系起來的，而經(jīng)絡所要描述的就是人體這種普遍聯(lián)系方式。
經(jīng)絡在人體有三個層次，最基礎的就是連續(xù)在全身的組織液，它在人體幾乎占70%，所有細胞都浸潤在組織液中，因此，在中醫(yī)學上有”全身無處不經(jīng)絡“之說；宏觀的層次就是神經(jīng)和血管，它們是維束管道，負責物質(zhì)和信息的快速傳遞；中間的層次就是十四經(jīng)絡，它們是半通透性質(zhì)的，物質(zhì)和能量在其中一面?zhèn)鬟f，一面向周圍組織擴散。這三個層次是統(tǒng)一的整體，共同描述了人體的普遍聯(lián)系。
第二，系統(tǒng)科學可以幫助我們認識人體所出現(xiàn)的種種神奇現(xiàn)象。氣功外氣和特異功能是現(xiàn)代科學解釋不了的，但它們卻客觀存在，背后的原因是什么？如果沒有正確理論的指導，靠碰運氣的方法恐怕一輩子都找不到正確答案。而有了系統(tǒng)科學的指導，我們就可以清楚地知道，自然界的物質(zhì)是層次存在的，一種普遍聯(lián)系方式對應著一種自然力，也對應著一個物質(zhì)層次，生物的與眾不同是因為一種特殊的自然力而體現(xiàn)出來的。
生物的普遍聯(lián)系方式是什么？通過對水分子的認識，現(xiàn)在已經(jīng)基本上清楚了，它是通過自由氫質(zhì)子在水分子鏈上的快速遞進，通過包絡在無機離子周圍的有序水層的周期組織與離散來進行傳遞的，這其實就是所謂的內(nèi)氣，外氣和特異輻射是內(nèi)氣的一種外顯，它必然也對應著分子的周期組織與離散，不同的只是外氣是這種能量波的散射狀態(tài)，而特異輻射是這種能量波的類激光形式。
第三，系統(tǒng)科學可以幫助我們認識大腦的秘密。腦科學是現(xiàn)代科學中最前沿的科學，可靠精密儀器是無法進行下來的，因為這里的過程根本無法觀察。要正確地認識它，只有靠正確方法論的指導，而系統(tǒng)科學就是這個正確的方法論。
系統(tǒng)科學告訴我們，作為人體的中心，它必然有一種主導性的力量支持，而這種力量在人體就是血液，中心正是通過血液對各組織的不對稱供應控制了全身。什么因素控制著血液呢？當然是以心臟為核心的臟腑系統(tǒng)，它們才是人體真正的中心，大腦在這里只是按照心的意志對來自全身的信息優(yōu)勝劣汰的一個容器。這個過程頗象激光的產(chǎn)生原理，所有信息在大腦前額區(qū)進行競爭，優(yōu)勝劣汰，結(jié)果和心的意志相和拍的信息，就得到了血液的優(yōu)先支持，使它迅速由弱變強成為統(tǒng)治者，并由它強迫其它信息和它同步運動，反饋到全身，這才形成了整體步調(diào)一致的意識活動。
第四，系統(tǒng)科學可以幫助我們搞清楚中藥藥理。中醫(yī)和西醫(yī)對病因的認識不同，治療的方法也完全不同，西藥是用來殺死病變細胞的，而中藥是用來恢復整體管理的。西藥的標靶是病變細胞，而中藥的標靶是病變細胞的營養(yǎng)通道——經(jīng)絡，對于細胞的功能亢進，中醫(yī)就用中藥堵塞它，缺乏了營養(yǎng)，亢進自然停止；對于細胞的功能低下，中醫(yī)就用中藥疏通它，得到了更多的營養(yǎng)，低下的細胞功能自然增強。
現(xiàn)在我們研究中藥為什么長期沒有進展，原因很簡單，那就是靶子瞄錯了！中藥的靶子是經(jīng)絡，不去研究經(jīng)絡，卻跟著西醫(yī)去研究中藥的化學成分，恐怕再用上三百年，也研究不出什么成果。要證明中藥藥理，就必須證明經(jīng)絡在人體分布的規(guī)律，它不僅有明確的層次，而且每一條經(jīng)絡都存在一種規(guī)律性，即對應同一條經(jīng)絡，不管是黑人還是白人，不管是大人還是小孩，它的基本孔隙大小應該是一個常數(shù)。只要證明了這一點，中藥藥理就得到了科學上的證明，一個全新世界醫(yī)藥標準就出現(xiàn)了，它比西藥高明得太多了！
第五，系統(tǒng)科學可以讓我們明確中醫(yī)學所有基礎理論。比如陰陽五行學說，站在氣一元論之上，陰就是氣之有序狀態(tài)，陽就是氣之無序狀態(tài)，陰陽變換的學說其實就是一個標準的系統(tǒng)學規(guī)律，同理，五行也不是五種不同的材料，而是同一種物質(zhì)（氣）的五種不同運動形式，它廣泛存在于自然的每一個物質(zhì)系統(tǒng)當中，五行學說就是用來揭示系統(tǒng)內(nèi)部物質(zhì)運動規(guī)律的。
中醫(yī)學中有很多與西醫(yī)完全不同的理論，如藏象學說，體質(zhì)學說，運氣學說，病因?qū)W說，病機學說，診斷學說，藥理方論，以及心主神志，五臟藏神等，要正確理解它們，唯一的方法就是站在系統(tǒng)科學之上，否則，象西醫(yī)那樣只注重實體，而忽視了它們與周圍的關系，是不可能正確認識這些學說的。如藏象學說，藏就是看不見的，象就是看得見的，藏象學說描述的就是看得見的臟腑之間那么看不見的關系。
總之，中國古代就建立了一個完整的系統(tǒng)科學體系，它就體現(xiàn)在中醫(yī)學的氣理學說中，氣即氣一元論，它是系統(tǒng)科學的前提假設，理則陰陽五行學說，它描述的系統(tǒng)的發(fā)展規(guī)律和系統(tǒng)內(nèi)部的物質(zhì)運動的規(guī)律。中醫(yī)學就是建立在這個系統(tǒng)科學之上的。中醫(yī)要想科學化，就必須把氣理學說轉(zhuǎn)化成現(xiàn)代人能夠看懂的系統(tǒng)科學，唯有如此，中醫(yī)的振興才有希望。
