對于一般的非生信專業的小碩來說,在拿到公司的測序數據后,在Windows平臺上就可以完成想要的數據分析。仔細想想,我們平常打游戲用Windows,看電影用Windows,現在搞個專業分析還是用Windows,我們就離不開Windows系統了是吧?
其實,除了Windows,還有一個系統大家也可能聽過,那就是大名鼎鼎的開源系統Linux。現在實驗室一般都會做個轉錄本測序,測序的流程一般是先構建文庫,然后上機測序,測序完的下機數據是原始的峰圖,從原始的峰圖轉換到轉錄本差異表達分析之間的這些工作都是由專業的生信人員在Linux系統里完成的。對于很多領域的專業人員來說,能在Linux下工作是必備的一項技能。
這里就為大家介紹一個簡單的方法在Windows里體驗Linux系統,即用虛擬機安裝Linux。常用的虛擬機有VMware Workstation和Virtual Box等。Virtual Box是免費的,但這里我們要用的是收費的VMware Workstation,因為后者更加強大,而且在國內,你懂的,國外的收費軟件到國內也是免費的。VMware Workstation既可以裝各種版本的Linux,也可也裝Windows,Mac OS,Android,是的,如果你沒用過蘋果電腦的Mac OS系統,如果你手機不是最新的Android 7.0 Nougat,那么你照樣可以用VMware Workstation去體驗這些系統。
首先,我們要有一臺電腦,筆記本、臺式機都可,Win xp,Win 7,Win 8,Win 10都可,電腦內存最好是4G及以上。
在百度里搜索“VMware破解版”,下載的安裝包里一般都有序列號,在安裝好VMware Workstation后把序列號輸進去就可以正常使用軟件了。
Linux系統版本眾多,這里我們選擇了近年來比較流行的Ubuntu進行安裝。在百度里搜索“ubuntu”,找到ubuntu的官網,選擇Ubuntu 16.04 LTS版下載。
打開VMware Workstation,選擇“創建新的虛擬機”。
這里我們選擇最簡單的“典型”進行安裝,按“下一步”。
選擇“安裝程序光盤映像文件”,單擊“瀏覽”選擇剛才下載的Ubuntu系統文件,單擊“下一步”。
全名隨便輸入,用戶名為登錄Ubuntu系統后的賬戶名,密碼為登錄賬戶的密碼。輸入完成后單擊“下一步”
安裝位置建議放在除C盤外的其它磁盤,專門建立一個文件夾存放。
磁盤大小20GB就夠了。如果電腦性能強悍,可以選擇“將虛擬磁盤存儲為單個文件”,反之性能不那么強悍的電腦可以選擇“將虛擬磁盤拆分成多個文件”以提高性能,這里我選擇的是后者。單擊“下一步”
單擊“自定義硬件”,進入到硬件配置選項卡。
這里主要調整內存和處理器大小。比如我的電腦是四核四線程,4G內存,那么我可以分配給虛擬機1G的內存,2個核心處理器。分配給虛擬機的資源越多,虛擬機之外的Windows平臺的性能就會受到影響;但如果分配給虛擬機的資源過少,則虛擬機自身性能受限,所以需要根據自身的電腦配置合理的分配資源。
單擊“關閉”后,再單擊“完成”。虛擬機會自動開始安裝Ubuntu系統,安裝時間大約為10分鐘,之后會啟動系統進入到登錄界面。在此輸入之前填寫的賬戶密碼。
Ubuntu界面如下,默認帶有firefox瀏覽器以及一些常用的軟件。
用VMware Workstation安裝Ubuntu的流程到此結束,大家可以隨心所欲的在虛擬機里折騰啦。
當然,除了Ubuntu,還有幾個Linux操作系統值得推薦:
1.Deepin 國產Linux系統,針對國人的需求進行了優化, flash、中文輸入法等一些軟件都已經裝好并可以直接使用,在眾多linux系統中娛樂體驗性最好。缺點是虛擬機下安裝會有些卡頓,估計后續版本虛擬機體驗會有所改善。
2.Bio-linux 基于Ubuntu提供500多個生物分析程序,對于生信人員來說省去了很多軟件的安裝過程。
3. Red Hat Enterprise Linux 系統穩定,適合作為服務器用,缺點是圖形界面差。
4.Kali Linux 最為萬能并且先進的滲透測試工具發行版操作系統,黑客們的最愛。好啦,以上就是本期的內容,希望大家喜歡!