手太陰肺經“從肺系橫出腋下”之論已深入人心，至于橫出腋下的起始穴問題，從古到今則又存在著兩種不同的說法：一說起于云門穴（《針灸甲乙經》等）；一云起于中府穴（《銅人腧穴針灸圖經》等）。對此，筆翻閱古今醫籍見解如下。
1.云門穴最早見于《素問·水熱穴論》中，《脈經》和《針灸甲乙經》均認為云門是手太陰脈氣所發之處，故將云門定為手太陰肺經的起始穴。中府穴首見于《針灸甲乙經》中，被列為手太陰肺經的第二個腧穴。唐代的《千金要方》和《外臺秘要》均依從《針灸甲乙經》之說。只是宋代王惟一在《銅人腧穴針灸圖經》中才將云門、中府二穴的排列次序互易，定中府穴為手太陰肺經的起始穴。從此，元代的《十四經發揮》，明代的《針灸聚英》《針灸大成》《類經圖翼》《循經考穴編》，清代的《醫宗金鑒》乃至現今的針灸教材、著作又均依從后說。但在宋代以后的幾百年中，也有不少文獻諸如《蠡海集》《錦囊秘錄》《標幽賦》《針灸問對》，以及近人黃竹齋的《針灸經穴圖考》、日本學者小版元佑的《經穴纂要》等仍遵循《針灸甲乙經》的排列次序，定云門為起始穴。
《錦囊秘錄》中說：“人之氣血，周行無間，始于手太陰，出云門穴，歸于足厥陰，入于期門也。”《標幽賦》云：“太陰為始，至厥陰而方終，穴出云門，抵期門而最后。”
王啟才教授認為:《針灸甲乙經》為同時記載云門、中府二穴的最早針灸文獻，理應作為確定手太陰肺經起始穴的主要依據。《銅人腧穴針灸圖經》之后的謬種流傳，實不足為憑。
2.其次，據手太陰肺經“從肺系橫出”的經脈循行走向分析，從云門下中府，再沿肩臂下行，較之先下中府，又上云門，再下肩臂更加順理成章，合乎經脈循行的走勢規律。
3.最后從古代醫家對腧穴的命名含義來看，門者，經氣出入之門戶也。十二經脈的流注是從手太陰肺經開始，至足厥陰肝經而終，又從肝經傳注肺經，如此循環往復，周流不息。經氣從手太陰肺經起始后就有一個從體內淺出體表的部位，既然是“出”，這里就涉及一個經氣出入之門戶的問題了。《千金方翼》中說：“凡諸孔穴，名不徒設，皆有深意。”手太陰肺經為十二經流注之首，肺在上，主氣，其脈氣所出，猶如大自然之云氣。故《靈樞·玉版》說：“云氣者，天下也。”《素問·陰陽應象大論》中說：“云出天氣。”云門即“天氣”出入之門戶。足厥陰肝經為十二經流注之末，最后一個腧穴是期門，至此，十二經脈氣血流注已經完成一個周期，而從期門穴入里復注于手太陰肺經。古代醫家把手太陰肺經經氣所出之穴命名為“云門”，把足厥陰肝經的最后一個腧穴命名為“期門”，象征著十二經脈氣血從云門淺出體表，從期門深入體內，其寓意是十分深刻的。
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