1924年英國的考古學家帶著17歲的女兒去考古，這個女孩在瑪雅城市盧班圖姆發現了個水晶頭骨，后經檢測，這個頭骨至少有三千六百年的歷史。
這個頭骨是用一整塊的水晶雕刻而成，而且頭骨的下顎還可以活動。根據人們對水晶的研究，這個水晶頭骨理論上是屬于超自然的存在，因為它的工藝違反了水晶的自然屬性，即便是利用現代工藝，也無法制作出這樣的水晶頭骨。
據說水晶頭骨共有52顆，瑪雅人擁有13顆，其余的分布在世界各地。52顆頭骨中有13顆下顎是可以活動的。曾經一個村莊里的神父有幸見到過一顆，但神父見到水晶頭骨第一反應就說它是魔鬼制造的，上帝是不會創造這種東西的，隨后便毀壞了頭骨。
傳說這些水晶頭骨是天狼星外星人送給地球人的禮物，他們為了幫助人類發展文明，所以從天狼星帶來了這些水晶頭骨，頭骨中存有宇宙的起源和宇宙的未來；起初只有13顆，其中一顆是厄運頭骨，祭祀用的，大祭司如果想處死誰，就用這顆；剩余的39顆是在地球上制作的。
美洲印第安人中一直流傳著一個傳說，古時候有13顆水晶頭骨，可以說話、唱歌，頭骨中隱藏著驚天的秘密。根據瑪雅人的記載，瑪雅的大祭司要用水晶頭骨發布命令或者和上天溝通。
不論傳說真假與否，水晶頭骨是確實存在的。在1927年又發現了另一顆水晶頭骨，這顆頭骨的五官比例和人類的一模一樣，經過科學研究，水晶頭骨的確是瑪雅時代的產物，而且頭骨眼窩的下方有一個類似鏡面的東西，對光產生折射后，能發出炫目的亮光，看時間長了會產生眩暈。
水晶頭骨經過科學檢測，它還擁有特殊的磁場，頭骨的水晶透明度和顏色還會微妙的不斷的循環變化，而且它還有一種香味，是從頭骨內部散發出來的，并且觸碰頭骨還會感覺到明顯的顫抖和推力，仿佛是拒絕觸碰一樣。在夜間的時候頭骨還會發出類似鳥叫的聲音。
關于水晶頭骨的制作工藝一直都是個謎，水晶的硬度和脆度都十分的高，打磨和做造型十分困難，而且瑪雅人還處于石器時代，沒有先進的工具，所以猜測，水晶頭骨不是以我們認知的方式制作出來的。
瑪雅長老會在近代十分出名，他們稱自己是印第安人和瑪雅人的長老，長老會的長老說13顆頭骨一把是鑰匙，集齊的時候，13顆頭骨的磁場和地球的磁場頻率達到一致，便能開啟地球磁場，從而打開地面，喚醒遠古的能量，并激活人類的意識，擴大我們的認知。
不管真假與否，即便是真的，13顆水晶頭骨其中一顆已經被神父毀壞（但愿毀壞的不是下顎會動的），無論如何都無法集齊了。
