前幾天一個學員向我咨詢了這么一個問題，她們公司姑且稱為A公司，注冊地在A市，在本省另一個地級市B市承攬了某工程項目，一般計稅方法計稅，并在當地成立了B分公司。2022年8月，甲方根據合同支付了2800萬元預付款至三方共管賬戶，同時要求B分公司8月底前一次性開具1300萬元的進度款發票，才能支取共管賬戶的資金。
1.納稅主體的確定
根據國家稅務總局公告2017年第11號第二條的規定，建筑企業與發包方簽訂建筑合同后，以內部授權或者三方協議等方式，授權集團內其他納稅人（以下稱“第三方”）為發包方提供建筑服務，并由第三方直接與發包方結算工程款的，由第三方繳納增值稅并向發包方開具增值稅發票，與發包方簽訂建筑合同的建筑企業不繳納增值稅。發包方可憑實際提供建筑服務的納稅人開具的增值稅專用發票抵扣進項稅額。
倘若A公司與B分公司均為同一個企業集團，且A公司以內部授權或者三方協議的方式，授權B分公司為甲方提供建筑服務，自甲方收取工程款，并向甲方開具增值稅發票，則B分公司為本項目的納稅主體。具體而言，由B分公司負責預繳稅款、納稅申報、會計核算、開具發票。
2.2800萬元和1300萬元的性質
根據合同條款的約定，2800萬元以預付款的名義支付，甲方同時又要求B分公司開具1300萬元進度款的發票，那么應當將此2800萬元的款項一分為二：1300萬元在開具帶稅率發票當天發生納稅義務，稅收性質上等同于工程進度款；剩余的1500萬元仍然屬于工程預收款，應當按照財稅〔2017〕58號文的規定進行處理。
3.稅收處理
1300萬元對應的款項開具9%的發票以后，確認銷項稅額1300÷1.09×9%=107.34萬元，應當在2022年9月向B分公司主管稅務機關申報期申報納稅。
1500萬元對應的款項可向甲方開具編碼為「612」的不征稅普通發票，同時在收款之日起的6個月內，向B分公司主管稅務機關預繳稅款1500÷1.09×2%=27.52萬元，為盡量降低納稅現金流出，建議B分公司在9月申報期之前預繳并取得完稅憑證。
9月申報期B分公司申報時，假定沒有進項稅額，則本月應補稅額=107.34-27.52=79.82萬元。
4.會計處理
假定B分公司適用企業會計準則。
（1）收到2800萬元預付款時
借：銀行存款2800萬元
貸：合同負債2800÷1.09=2568.81萬元
應交稅費—待轉銷項稅額231.19萬元
（2）開具1300萬元發票時
借：應交稅費—待轉銷項稅額107.34萬元
貸：應交稅費—應交增值稅（銷項稅額）107.34萬元
（3）預繳稅款27.52萬元時
借：應交稅費—預交增值稅27.52萬元
貸：銀行存款27.52萬元
（4）納稅申報補繳稅款79.82萬元
借：應交稅費—應交增值稅（轉出未交增值稅）107.34萬元
貸：應交稅費—未交增值稅107.34萬元
借：應交稅費—未交增值稅27.52萬元
貸：應交稅費—預交增值稅27.52萬元
借：應交稅費—未交增值稅79.82萬元
貸：銀行存款79.82萬元
5.企業所得稅處理
首先，B分公司以項目部的形式在B市施工，無需按照實際經營收入的0.2%預繳企業所得稅。
其次，2022年8月B分公司并未開始履約，只有收款和開票以及預繳增值稅，因此無需確認會計收入和企業所得稅收入，也就是無需按照季度預繳企業所得稅。待施工活動開始以后，再按照國稅函〔2008〕875號的規定確認收入和成本，進行季度預繳和年度匯繳。
當然，具體又可分為兩種情況，一種是B分公司作為獨立的企業所得稅納稅人，在B市獨立繳納企業所得稅，另一種是是與A公司匯總計算應納稅額，然后按照三因素法分配納稅。
