眾所周知,人類細胞可產生成千上萬個不同的microRNA(miRNAs),其中miRNAs是些小片段遺傳物質,有助于確定特定時間打開或關閉哪一個基因。miRNAs是正常細胞功能的一個重要部分,但能促發人類疾病,如:特定腫瘤內的一些miRNAs被升高,則會促進細胞存活。為了更好地了解miRNAs如何影響健康與疾病,研究人員首先必須知道哪一個miRNAs作用于哪一個基因,考慮到miRNAs絕對數量與單個miRNA調控成百上千個基因的事實,這是一個很大的挑戰。現在,有一種名為miR-TRAP的新方法問世,它使用方便,可直接鑒定細胞內miRNA靶標。
與現有鑒定miRNA靶標的方法相比,miR-TRAP更簡單、更精確,主要理由有3個,分別是:首先,miR-TRAP可直接鑒定正常或疾病情況下活體細胞內的miRNA靶標;其次,不僅能識別出被miRNAs減少的mRNA靶標,也能識別翻譯被抑制的蛋白質靶標,這一靶標通常不能被其他技術檢測出來,如熒光定量PCR或芯片分析;第三,不依賴于抗體,因為抗體能導致非特異性背景信號和復雜數據解釋。通過對2個重要miRNAs的13個預測靶標的分析,這項技術不但確認了已知的基因靶標,還揭示了2個新靶標。(生物谷bioon.com)
miR-TRAP: A Benchtop Chemical Biology Strategy to Identify microRNA Targets
Huricha Baigude, Ahsanullah, Zhonghan Li, Ying Zhou, Tariq M. Rana
It′s a TRAP! microRNAs (miRNAs) are noncoding small RNAs that consist of approximately 21 nucleotides and are assembled into an RNA-induced silencing complex (RISC), which suppresses target mRNA expression. An easy-to-use method called miRNA target RNA affinity purification (miR-TRAP) directly identifies miRNA targets in vivo. This method could be widely used to discover miRNA targets in various disease models under physiological conditions.