李約瑟沒有說清楚他所謂的科學是指什么。他經常將科學和技術這兩個詞混在一起使用。他給人一種印象，中國古代的科學其實就是近代意義的科學。如果中國近代沒有能夠產生近代科學，何以古代反而有近代科學，而且很發達呢？
吳教授得出的結論是：
無論是在近代數理實驗科學的意義上，還是在西方理性科學的意義上，中國古代都無科學。這曾經是中國學界的公論和共識。
由此他回答了李約瑟難題：
如果他所謂的科學指的是西方歷史上出現的主流科學，那么中國古代根本就沒有科學，更談不上“中國古代科學很發達”。他的問題“為什么近代科學沒有在中國產生？”也很好回答：因為中國文化中根本就沒有科學的種子（基因）。
