嬴政滅楚之后，統一大業基本上只剩下掃尾工作了。他派王翦的兒子王賁繼續攻燕，在遼東把燕王喜給抓了，燕國滅亡，回軍的時候順手把代地的趙國殘余部隊代王嘉給滅了，北方平定。
王賁的父親王翦則繼續攻略楚地，他攻下了江南一帶，越君投降，南方平定。
嬴政往東邊一看，只剩下一個齊國了。齊國是戰國時期很奇葩的國家，秦滅五國時，采取“遠交近攻”之計，不停地拉攏他，齊國在五國危難之際一兵不派，一糧不發。等到五國相繼滅亡，齊王開始蒙圈了。嬴政讓齊王稱臣，齊王這才反應過來，將軍隊派在邊境上。但此時齊國已經是溫水煮青蛙了，舉目四顧，全天下已經沒有援軍了。王賁率領的百戰之師從燕國故地一路殺下，一舉攻破齊國的國都臨淄，齊國滅亡。
咸陽宮里，嬴政長舒了一口氣。多少代秦王甚至是百姓的夢想終于實現了，中華民族實現了大一統。很多歐洲人不理解中國這么大，雖然有過分裂，為什么統一是主流。歐洲面積和中國差不多，但有很多小國，存在語言和文化的差異。其實，這個時候的秦國也面臨著這樣的挑戰，各國語言、文字、貨幣都存在差異，嬴政如果不把這個問題處理好，很可能就會導致分裂。所以說，軍事上的統一還僅僅是開始，更艱巨的任務還在后面，就是從政治、經濟各個方面實現大一統。
在秦國統一中國之后，嬴政自認為這是亙古未有的功業，必須改變“王”的稱號，否則將“無以稱成功，傳后世”，顯示自己的“豐功偉績”。丞相王綰和御史大夫馮劫、廷尉李斯等人為嬴政商議稱號，他們認為古代有天皇、地皇和泰皇，其中泰皇最好，所以，給秦始皇定的稱號是“泰皇”，嬴政反復考慮，認為自己“德兼三皇，功蓋五帝”，決定兼采“皇”、“帝”之號，將這兩個稱呼結合起來稱為“皇帝”，成為帝制時代最高統治者的稱號。嬴政自稱“始皇帝”，后世俗稱“秦始皇”。同時規定，皇帝頒布的命令稱“制”，頒布的文告稱“詔”，自稱“朕”。
皇帝一詞樹立了天下君主的典范，從秦始皇開始，以后的天子都稱皇帝了。只是從此以后，“皇”由名詞變成了形容詞，如“皇宮”、“皇家”、“皇商”等等。
秦始皇還將最尊貴的“和氏璧”制成了傳國玉璽，上面刻有李斯撰寫的八個大字“受命于天，既壽永昌”。這方玉璽成為后世帝王帝位的象征，一直傳到了后唐，就此失蹤。三國時期，孫堅、袁術為此丟了性命，只有孫策實惠，拿玉璽向袁術典當，借了兵平定江東六郡。
提到郡縣，這又有秦始皇的功績。秦統一后，在中央設三公九卿制，三公是丞相、御史大夫、太尉，九卿是奉常、郎中令、衛尉、太仆、廷尉、典客、宗正、治粟內史、少府。前文提到的王綰是丞相，馮劫是御史大夫，李斯是廷尉。丞相是百官之長，相當于總理。御史大夫是副丞相，主管監察。太尉管軍隊。
但是光有中央政府機構而無地方行政機構，仍然形不成強大的封建統治網絡。但建立什么樣的地方行政機構，這在秦統一六國之后是經歷了一場激烈爭論的。以丞相王綰為首的群臣，主張沿用周代以來的封國建藩制度，分封諸皇子為王。他們的理由是有利于統治新征服的六國地區。而廷尉李斯則力排眾議，主張廢除分封諸侯制度，全面推行郡縣制度。這得到了秦始皇本人的認同，因為他自己就是諸侯爭霸的親歷者和終結者，他不會允許他剛剛建立的帝國出現目無天子，不斷攻伐的局面。所以說，郡縣制更符合專制皇權和統一的要求，因此得到了秦始皇的采納，他將全國分為三十六郡。后隨邊境的不斷開發和郡治的調整，增至四十余郡。
郡，是中央政府轄下的地方行政單位，其組織機構與中央政府略同，設郡守、郡尉、郡監（監御史）。郡守，為一郡最高行政長官，掌全郡政務，直接受中央政府節制；郡尉，輔佐郡守，掌管全郡軍事；郡監，掌監察工作。
郡以下設縣或道。縣是秦朝統治機構中關鍵的一級組織，是從中央到地方政府機構中具有相對獨立性的一個單位。內陸設縣，邊地少數民族地區設道。滿萬戶以上的縣設縣令，不滿萬戶的設縣長。令、長為一縣之首，掌全縣政務，受郡守節制。縣令下設尉、丞。尉，掌全縣軍事和治安；丞，為縣令或縣長的助手，掌全縣司法。
縣以下設鄉、里和亭。鄉和里是行政機構，亭為治安組織。鄉設三老、嗇夫和游徼。三老掌教化，嗇夫掌訴訟和稅收，游徼掌治安。鄉以下為里，是秦國最基層的行政單位。里設里正或里典，其職能除與鄉政權職能大體相同外，還有組織生產的任務。此外，還有司治安、禁盜賊的專門機構亭。秦規定，兩亭之間相隔十里，設亭長。亭遍布于城鄉各要地。后來建立漢的劉邦就只是個小小的亭長。
中央的三公九卿制和地方的郡縣制共同構成了秦朝的政府組織，這就一改幾百年的封建制度，改為中央集權的君主制度。歷史書上一直都說，中國有幾千年的封建制度，其實到秦，就基本消亡了，當然后世還有一些反復，但已經不構成大流了。所謂封建，就是封邦建國，把功臣、親屬封給土地，西周就是典型的封建制，姜太公封到齊國，周公旦封到魯國。但秦始皇統一后，改變了封建制度，改為了中央集權的君主制度。正經的封建已經廢除了。
要知道，秦始皇所做的一切都是開創性的，沒有什么“模板”可以照搬的，但是他建立的這一套制度卻給后人留下了豐富的遺產。如果不是秦朝太短，也許我們就不叫漢人，不稱漢族，要叫秦人，秦族了。因為漢隨秦制，很多制度都是直接借用秦。
為了實現大一統，秦始皇還做了很多努力，首先是統一文字。在諸侯割據稱雄的戰國時期，“文字異形”。古代文字經歷長期的演變發展，在全國各地有很大的分歧，而且這些千變萬化的文字寫法也沒有一定的體系和結構規律，這就給政令的推行和各地的文化交流造成重重阻礙。秦統一后，頒布法令到原來六國之地還需要翻譯，詔書至桂林一帶一般人都不認識，可見統一文字已成為當務之急。于是，秦始皇下令“書同文”，派李斯和趙高、胡毋敬等人整理文字，以簡化秦文“小篆”作為標準字體，用于公文法令，通行全國，廢除了其它各種異體文字。又由李斯、趙高等人編寫了小篆字頒行全國，作為標準文字的范本供人學習。此外，秦始皇出巡所到之處都要立碑刻字以示天下，如泰山石刻，后來獄吏程逸又根據民間流行的字體，整理出更為簡明易行的新書體---隸書，作為日用文字在全國范圍推廣。隸書的出現是我國文字由古體轉為今體的重要里程碑。隸書就是今天通用楷書的前身。
統一文字是千秋萬世的大功績。先秦古字經過這次整理之后，字樣結構得以定型，這對貫徹法令、傳播文化起了重大作用。我國地廣人多，各地方言迥異，后來歷史上又多次出現分裂割據的局面，而文字的統一，成為維系中華民族歷史發展進步的一條生動鮮明的脈絡。長期以來，我國社會高度發展的經濟和文化屹立在世界文明的前列，這與秦朝大一統的開創之功有著不可分割的聯系。
秦始皇還統一貨幣，針對各國貨幣不一的情況，統一貨幣為外圓內方的秦半兩錢。
為了保證國家的賦稅收入，制造標準的度量衡器，秦始皇要求全國統一施行。1標準尺約合今23厘米，1標準升約合今201毫升，1標準斗約合今2010毫升，1標準斤約合今256克，1標準石約合今30.75公斤。
統一度量衡方便了民眾的經濟生活，也方便了國家征收國稅。即達到了便捷于民的目的，也達到了提高政府工作效率的目的。更深遠的影響還在在于它為后世提供了統一的計量單位。
秦始皇還統一車輛的規格，這樣走在路上會減少損耗。因為相同車距的馬車壓在路上車轍是一樣的，馬車順著車轍走，既省力又方便。
秦始皇同時將天下12萬戶富豪遷居咸陽，既提高咸陽的經濟指數，又加大了對這些人的控制。
秦始皇銷毀天下的兵器，鑄成了十二銅人。雖然沒有化劍為犁的詩情畫意，至少是保證了安全。
詩仙李白把這一段歷史記在了詩里，他是這樣寫的：
秦王掃六合,虎視何雄哉。
揮劍決浮云,諸侯盡西來。
明斷自天啟,大略駕群才。
收兵鑄金人,函谷正東開。
……
