1、承包面積小于實際種植面積的，要尊重歷史、尊重農民意愿，以實測面積為準。
2、承包地已被依法征占，并已得到相應補償，確權登記時要從承包地塊面積中減除，進行變更登記。
3、承包戶的承包地被全部征收、征用、占用，導致農村土地承包經營權全部喪失的不再確權發證。
4、無法復墾的承包地按原面積和用途確權。
5、二輪承包后村里又有調整過土地的，只要是民主協商，形成決議并且不違政策法規的，可依據土地承包現狀予以確權登記頒證。
6、在承包土地上未批先建、改變用途的不予確權。
7、子女分戶由承包雙方出具書面分割協議，在協議分戶后予以分戶確權登記。
8、離婚的提交法院判決書或承包地分割協議書，沒有異議即可分別予以確權登記。
9、確權證書原則上按二輪承包時的共有人登記，出嫁女和入贅女婿可作為共有人進行登記或在土地經營權證書備注欄注明，娘家沒意見，出嫁女也可在娘家確權。
10、主動放棄二輪承包經營權未承擔農業稅費義務的按無田戶處理，不予確權登記。
11、農村二輪承包時，沒能力種田沒承包的孤寡、單身戶、五保戶，按無田戶處理，不予確權登記。
12、農村土地二輪承包時戶口外遷不在冊或按當時政策不符合分田條件的人員，目前戶口仍在外地或已回遷，要求分田的，暫不處理。
13、家庭承包人員死亡的，家庭承包戶沒有消亡，還按原承包土地確權登記；家庭承包戶消亡的，原家庭承包土地不予確權登記。
14、承包農戶代種他人承包地的，原則上不予確權。
15、當時未承包到戶的土地如何確權？農村土地二輪承包時，未承包到戶的土地原則上暫不確權登記，歸集體所有。
16、同一村民小組承包農戶采取轉讓、互換方式流轉承包地的，若雙方沒有異議，按實確權登記，若雙方有爭議的，按原二輪承包歸屬的面積和四至予以確權。
17、土地綜合整治或長期流轉的應按照土地綜合整治或流轉前的農戶承包關系確權。
18、有爭議的土地盡量通過調解解決，調解不成的可通過仲裁、訴訟程序，若仍不能處理暫不確權。
19、退耕還林領取了林權證的，本次不予確權登記頒證。如果沒有領取林權證，但領取了退耕還林補貼，應尊重農戶自己的選擇。
20、承包期內承包方全家遷入小城鎮落戶的，應當按照承包方的意愿，保留其農村土地承包經營權或者允許其依法進行農村土地承包經營權流轉。
21、生產公益事業占用承包地，已辦理征用手續并給與補償的，不計入承包地；未享受一次性補償的，仍按原農村二輪可承包面積確權登記。
22、承包期內承包方提出書面申請，自愿放棄全部或部分承包地的不再確權發證。
23、機動地、經濟地、荒地已納入承包地管理的繼續作為承包地管理；未納入承包地管理的，不再進行確權登記。
