清朝幅員遼闊，在沿襲了行省制度后又采取了其他種制度來管理地方事物，清朝在公元1644年，入主中原統一全國后，劃山海關內為18個行省。省下設道、府（州）、縣。
1、巡撫
省級機構清朝對明代省級政區進行了一系列的調整，最終將督撫的轄區與省的轄區調整為一致，同時督撫也真正稱為地方最高行政長官。到乾隆中期，全國確定為18個省級行政區，分別為直隸、江蘇、安徽、陜西、山東、河南、陜西、甘肅、浙江、江西、湖北、湖南、四川、福建、廣東、廣西、云南、貴州，其中直隸、四川和甘肅三省不設巡撫，分別由直隸、四川和陜甘總督直接管轄，共15個巡撫）巡撫是中國明清時地方軍政大員之一，清代巡撫主管一省軍政、民政。）
2、總督
清朝設直隸（北京、山東、山西、河北）、兩江（江蘇、安徽、江西）、陜甘（陜西、甘肅）、四川、閩浙（浙江、福建）、湖廣（湖南、湖北）、兩廣（廣西、廣東）、云貴（云南、貴州）8個總督，山東，山西和河南三省務總督，由巡撫兼理總督職責。（清朝時對統轄一省或數省行政、經濟及軍事的長官稱為“總督”，官階為正二品，但可通過兼兵部尚書銜高配至從一品。與只掌握一省行政事務的巡撫不同，總督兼管數省，同時在政務之外也兼掌軍務。）
清朝督撫總管全省政務和軍事，下面設主管財政的布政司和主管司法的按察司，還有提督（高級武官）、學政（主持教育科舉）、糧道（主管糧食）、鹽道（主管鹽政）和河道（主管水利）等屬官。
3、將軍轄區
清朝在全國一共設立了14個駐防將軍職位，駐防將軍為武職從一品，與加尚書銜之總督同秩 ，例以滿人專任。
同時東北和西北等地因為不設督、撫，駐防將軍為本區之最高軍政長官，形成了五個將軍轄區。其順序及官階總稱如下：總統伊犁等處將軍（駐地惠遠城）；鎮守黑龍江等處將軍（駐地齊齊哈爾）；鎮守吉林等處將軍（駐地長春）；鎮守盛京等處將軍（駐地沈陽）；烏里雅蘇臺定邊左副將軍（駐地烏里雅蘇臺。
其中伊犁將軍統轄地域之遼闊、軍隊之眾多，受其節制的軍政官員之多、官職之高，在清代全國 駐防將軍中，甚至就是在邊疆駐防將軍中，也是獨一無二的。
4、辦事大臣
辦事大臣，清代邊境軍政長官名稱。主要設置于西部邊境少數民族地區。清朝內蒙古地區由中央理藩院管理，青海由西寧辦事大臣統轄（駐西寧），西藏地區由中央策命的達賴喇嘛駐拉薩，掌管全藏政務，班禪額爾德尼駐日喀則，掌管后藏的寺院，全藏地區由駐藏辦事大臣全權管轄。
