為了保證果樹健壯生長，防止雜草無限制生長給果樹造成的肥水競爭，必須采取措施抑制雜草生長蔓延。目前，在常規管理的果園，雜草防除通常與土壤管理結合進行，一般采用青耕，行間間作其他作物，地面覆蓋，行間生草和化學除草等方法。
果園清耕是雜草防除最常用的方法，此法用工量大，一年要除草5~8次。果園間其他作物適宜幼齡果園，以豆科植物，薯類，蔬菜等作物為好，不宜間作玉米，高粱等高桿作物。地面覆蓋是栽培管理條件較好的果園采取的一種措施，覆蓋物以作物秸稈，割下的雜草或綠肥植物為主，地面覆蓋能明顯抑制雜草生長，減少水分蒸發，縮小地面溫差。秋冬季將覆蓋物深翻于地下，還能增加土壤有機質含量，改善土壤通透性。
行間生草是近些年推廣的果樹管理新技術，即在果樹間種植多年生牧草（一般是豆科），樹冠下實行清耕。在牧草生長到一定高度時割，留茬高度10厘米左右，為割下的草可以抑制雜草生長，保土保濕，減少水分蒸發。同時，還為害蟲的天敵提供了食料和活動場所，實踐證明，生草果園天敵數量明顯多于清耕果園。
化學除草是利用化學除草劑抑制雜草生長的方法，需要根據雜草種類和危害情況，果樹樹種或品種，土壤類型及氣象條件來選擇除草劑種類。化學除草的優點是除草效果好，省人工，但除草劑選擇或施藥方法不當容易出現藥害。現代果樹栽培提倡以樹干為中心，在樹冠下使用除草劑，在樹行間種植牧草的栽培模式。不建議常年使用化學除草法！
